版友好,我不是這方面的專業
因為幫老闆做相關的研究所以需要查詢這方面很多的知識
希望大家能夠幫幫忙~
現在面臨的問題是在非模式物種Gemmifera的情況下
利用velvet/Soap/Abyss三種組裝軟體組出contigs
目標在於用contigs與相近物種Thaliana進行比對
並得到一個整體比率以能夠代表與相近物種的相似性有多高
目前嘗試過BLAST.Bowtie.ALE.MUGSY等軟體
但是出來的結果都是一個contigs會有一個分數
但是老闆想要的是全部contigs的一個similarity分數
想問問版友們是否有這方面的知識或相關訊息@@!!!
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