推 kaikai1112:產業研究的吧 10/24 16:46
阿弄資料弄的好累來回一下好了
※ 引述《evana28 (煩)》之銘言：
: 各位好
: 我不是生技相關背景出身的
: 最近被老闆指派研究基因定序相關的產業
: 問的問題可能很粗淺
: 但請求各位的幫助
: 問題一：基因定序最終的目的是什麼?
: 就我目前在網路搜尋的結果，是把DNA片段的"AGCT"編碼順序找出來嗎?
: 那找出來之後，可以做什麼呢?
好的你要先了解所有的生物都是按照一個藍圖去打造 不是憑空蹦出來的
這個藍圖叫做你的染色體
裡面的最小單元就是四種鹼基 ATCG
那這個藍圖很大 非常非常大
整個染色體跟ATCG的關係大概就像是(GTA5+上古捲軸)^2跟000111的關係吧
好回來你的問題
定序的目的是什麼呢???
簡單來說有兩種
一是正向的你要去設計某個東西來做實驗
二是逆向的你想知道這個東西是怎麼會這樣的
一就像是你要寫出GTA裡面的樹葉好了
二就像是你想破解整個GTA的遊戲碼
: 問題二：台灣有很多做基因定序服務的公司，例如基隆米克斯、明欣..等等
: 這些公司存在的意義是什麼? 基因定序的工作不能研究單位自己在實驗室完成嗎？
: 另外，每一家基因定序服務的公司做的東西有差別嗎？
: 我以為是儀器買來資料輸入，資料就會自動輸出了
: 所以只要有錢買儀器，就可以開一家基因定序服務的公司了嗎?
: 基因定序服務的好跟壞，判別的標準是什麼?
定序一開始都是在自己實驗室做的
因為步驟很繁雜 還要跑很大張很長的毛細管膠(這是在我踏入這個領域之前了~"~)
自從有了機器全自動化之後這個現象就變了
當然你還是可以自己用老的方式定
也可以買機器自己定
就像同樣的你也可以買機器做麵條跟自己揉饅頭壓麵條一樣
好的接下來每家定序服務有差別嗎?
有
就算每家的機器都用一樣
每個操作員用的設定都會不同
上機的操作有些眉眉角角的東西
價錢 還有更重要的 品質
都會不同
並不是很單純的A -> B這樣
如果是的話 那很多不願意降價的公司不都不用活了
只要有錢買機器就可以開定序公司了嗎?
甚至不用
台灣現在也有公司是接了單之後全部把sample寄去中國上機的
然後還削價競爭
所以服貿大家真的要小心阿(菸)
定序的好壞判定是什麼
好這是一個相當主觀的東西
可能有的sample結構機器不好解
讀出來訊號不好
可能你的sample本來就有雜訊
可能這家公司一次讀不好
你就覺得這家公司很爛
可能有的sample這家公司解的出來 那家公司就不行
而且又有時候你的sample很珍貴
不想給定序公司浪費的時候
嗯
所以這麼多公司才都活的下去咩
: 問題三：引子合成又是什麼東西?
: 看到很多做基因定序服務的公司，都會有引子合成這項業務，這是什麼?
: 不知道問的問題對不對
: 如果問的方式錯了還請包含
: 另外能不能用比較淺顯易懂的方式說明呢
: 網路上搜尋到的資料都很專業，我實在看的霧煞煞
: 如果有人可以回答的話
: 真的非常感謝
引子是什麼呢
好的 你要定出一段序列需要有個標記
不然機器不知道要從哪裡開始讀
這個標記就是引子
其實就是一小段的DNA序列
會跟序列互補的DNA黏在一起
然後機器就知道要從這裡開始讀
為什麼定序公司通常都也有引子合成業務呢?
因為要定序一定要primer阿
讓你花錢一次花完就好
省的東跑西跑 他還少賺一票
如果東西有問題 自己公司裡也比較好處理吧
還有就是會賣定序機的廠商都有出oligo合成機
大概一起買有打折吧...
我比較想問原po是做什麼的?
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