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首先謝謝各位高手願意右轉此篇文章...... 事情是這樣的, 目前手上有一條已知序列,利用BLASTX及ClustalX 已找出與該序列相似度較高的其它胺基酸序列 請問各位會依此發展出何種較有研究份量的分析應用呢? 老闆說可以比較不同物種之高保留度的domain或motif......then? 因為碩班畢業時間迫在眉睫,bench work是暫不考慮了 希望能用生物資訊,大量整理文獻的方式生出個data 懇請各位高手給些意見了,萬分感激不盡! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 163.24.254.214
liuse:你這序列是已知的gene還是未知的gene?你要看的方向是? 03/17 02:30
liuse:演化?可能功能角色?結構? 03/17 02:30
jessicada:比對後已可推測該gene與abc transporter相關;請問以功 03/17 05:01
jessicada:能或結構上來說,還能用這些比對做出哪些的data呢? 03/17 05:01
Ianthegood:abc的功能實在太廣泛了 就朝一個想要的方向多嘴砲 03/17 10:21
jabari:朝一個方向 @w@ trans 或 cis 這種嗎? >///< 03/17 18:43
puec2:1. 找在abc transporter上做突變探討功能的paper 03/17 23:12
puec2:2. 比對你的gene在相對應的位置上是什麼氨基酸 03/17 23:13
puec2:3. 根據特定點氨基酸種類的異同,討論你的基因的可能功能 03/17 23:14
puec2:有認識人的話,可以取一段與已知結構蛋白質序列相似的 03/17 23:15
puec2:motif出來做modeling XD 03/17 23:15