[閒聊] TALENs與CRISPR

[blut0806 (Blut_Kreuz)]

拍謝
這是小弟第一次發文
如果排版不好還請見諒




不知道版上有沒有人有對TALENs或者是CRISPR有所涉略?

最近我老闆要我去找相關PAPER
也看了幾篇有所理解
似乎是出錯率低又精準的技術

不知道各位版友怎麼看?




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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) 
◆ From: 140.128.17.107
→ soom:可否再說明一下你的想法，以便拋磚引玉，幫助討論
→ newmankind:我也想找這方面的資訊，雖然TALEN有kit，
→ newmankind:不過用的人好像不多
→ newmankind:有用過的先進，可以分享一下心得嗎?
→ newmankind:目前個人的理解是，雖然宣稱是knockout基因，
→ newmankind:不過好像有需要特別的序列(結構?)
→ blut0806:目前我是TALENs的paper看得比較多, CRISPR則
→ blut0806:僅在一篇review讀過,
→ newmankind:Addgene(聯奇)有出一套TALEN的KIT，不過成大沒人用過
→ newmankind:也不知道效果好不好
→ blut0806:而整個TALENs的構成,都是兩兩一組,分別定位在指定的DNA
→ blut0806:雙股兩側, 可以這麼辦到是因為TALENs的結構,在一個單元
→ blut0806:體中, 重要的部分有二, 一是C端的FokI及整組結構中間的
→ blut0806:DNA binding domain,則由約15個胺基酸的重複序列構成
→ blut0806:而該重複序列則由約34個胺基酸構成,但其中重要的是第12
→ blut0806:及13個,這邊決定了該段所結合的核苷酸對象
→ blut0806:結構大概是這樣吧...話說要怎麼用圖片上來?
→ blut0806:至於new大你說的那個KIT我也沒有用過QAQ
推 mesenchymal:https://www.addgene.org/TALEN/guide/
→ mesenchymal:現在CRISPR正火,因為你只需要的是guide sequence
→ mesenchymal:specific binding to DNA element, 不像TALEN需要
→ mesenchymal:protein DNA binding (而一些papers claim CRISPR
→ mesenchymal:offtarget effect 相對小,Cas9相關paper也幾乎是一個
→ mesenchymal:月就可能出好幾篇,應用也不再局限於 gene knockout
推 mesenchymal:http://ppt.cc/Y-nQ 你可以看一下這篇討論 ZFN,TALEN
→ mesenchymal:還有CRISPR的比較,http://ppt.cc/~HJc 這篇則是較新的
→ mesenchymal:CRISPR應用的整理
推 datro:力鈞的教學 算上的蠻清楚的 可以去聽看看
→ blut0806:M大:我先看下應用那篇, D大:力均是指?拍謝我接住這個領域
→ blut0806:沒多久還望海涵諸多不懂.
→ blut0806:                                         接觸
推 newmankind:感謝m大資訊，我也來看看
推 demoiselle:力鈞現在在促銷CRISPR，舉辦多場workshop，親自參加操
→ demoiselle:作ㄧ遍，應該會很有收穫吧! 反正是免費的~相信workshop
→ demoiselle:中也會比較幾種傳統的製作方式跟CRISPR的優缺點
推 mesenchymal:剛去看了一下poster,發現張鋒lab那套Cas9 knockout
→ mesenchymal:creen library未來應用性很大,有興趣可看
→ mesenchymal:http://ppt.cc/2qk3
推 newmankind:下禮拜成大有辦一場，來去聽聽看