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想請問大家, 做Relative quantification的real-time PCR前 都會先確認PCR efficiency嗎? 查的文獻說一定要統一PCR efficiency 做出來的數據才有意義.... 可是我們老師認為沒有做的必要, 沒有人在做....問了隔壁研究室的前輩, 也說他們實驗室也沒有人在確認這個的, 請問大家的實驗室也不會確認嗎? 這樣做出來的DATA發表paper的話,會不會有問題呢? 謝謝回答^^ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 118.155.71.46 ※ 文章網址: http://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1416483453.A.516.html
qiet: 很多人都沒有做, 但建議可以測試一下較安心 11/20 22:10
skyken10: http://www.rdml.org/clinchem.2008.112797v1.pdf 參考 11/21 01:01
skyken10: 一下這篇paper,你就會知道需不需要做了! 11/21 01:01
liuse: 你不做要怎麼算之後的data 都當成double per cycle? 11/21 08:50
svc1213: 投稿時 ,曾經被問過 。 11/22 23:58
WinnieDad: 的確不少researchers和publications就直接假設是2了… 11/23 14:08
LeonPPK: 可以加做一個standard curve就可以確認了 12/01 00:16
jabari: 你有幾個gene要測?大於4個的話直接改算相對表現量改變 12/03 19:17
jabari: 反正你有放control 又有house keeping 多於4個基因還作eff 12/03 19:18
jabari: 只會殺了自己尤其是(真)standard curve是算copy number的 12/03 19:18
jabari: 打太快 是改用'進階'相對表現量改變 就是有個對照基本樣品 12/03 19:20
gps0110: 借這篇問一下 如果用ddCt法做relative quantification的 12/04 01:57
gps0110: 話 需要每盤都有housekeeping gene嗎?sample很多 一盤 12/04 01:57
gps0110: 放不下 每盤都要housekeeping gene的話要做的量一下子多 12/04 01:57
gps0110: 好多 12/04 01:57