[求救]CHIP 完之後 設計Primer 跑q-PCR

[orzman17 (God Bless Taiwan)]

目前CHIP完純化好DNA

也找好預測定的基因片段序列

可是設計primer 似乎要在 預測定的基因片段的promoter上

NCBI上在預測定序列 往前推了1000 base 找了很久

找不出來哪裡是promoter   也不知道primer怎麼設計  囧



補充:預測定基因是Prox1  物種是Rat


請各位大大 協助      小弟在此謝過> <



※ 編輯: orzman17 (1.175.170.211), 03/20/2015 00:51:52
→ blence: 對於這類的問題,如果是找"TF貼在哪段promoter"為實驗目的
→ blence: 究竟是reporter assay,還是用ChIP比較會優先考量？
→ blence: 我是覺得reporter簡單,可是會你不知道prom就應該是沒做過?
推 yuyu219: reporter是另外送進去的plasmid，方便，但不一定是真實
→ yuyu219: 狀況，ChIP會較貼近實際狀況，會做ChIP通常應該是想看his
→ yuyu219: tone modification
→ blence: ChIP是想呈現直接bind證據,用TF直接IP就好,無關histone阿