[情報] 普生作業...

[ss5505ss (ss5505ss)]

抱歉讓大家等這麼久，我看了好久問了好多人還是有地方不太懂，希望不會錯，

老師的講義真的好難懂...

p.41

連上這個網址：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/e-pcr/

然後點選圖片上的"Forward e-PCR"，然後在那個很大的欄位裡輸入"AC012557"點

選"Submit Query"，然後按Ctrl+F把所有有Homo sapiens的項目找出來就OK了。

p.57

簡單來說，就是一個BAC clone有1.5x10^5那麼長，人的有3.0x10^9那麼長

然後BAC和BAC之間重疊的部分有3x10^4那麼長，要算需要幾個BAC才能cover

整個human genome?

(1.5x10^5 - 3x10^4) x N + 1.5x10^5 = 3x10^9

N + 1 = 24999.75 所以 N = 25000

答案僅供參考

p.80

簡單來說就是用p78和p.79兩頁的網站，根據步驟然後就可以有答案了...

http://www.ensembl.org/biomart/martview/<----這是網址

步驟：

１.按下上面紅色的"New"，確認Dataset是Homo sapiens genes，然後右方的Database

   是Ensembl 43。

２.點一下Homo.....下方的"Attributes"右方勾選"Sequences"，然後點一下下方

   "SEQUENCES"左邊的"+"勾選"Coding sequence"。

３.回到左方點一下"Filters"，右方點"REGION"旁的"+"，"Chromosome"打勾選擇"1"

   "band"打勾，然後...

   這邊比較有問題的是在輸入band的start和end的地方，根據題目給的SCA19的基因

   是落在一號染色體的p21-q23，但是我發現不輸入小數點他是算不出來的（輸入0

   也一樣），如果要包括整個p21和q23的話，應該就是從p21.3到q23.3（p21和q23只

   到.3）關於小數點的問題請參考：

http://www.bhp-gc.tw/front/bin/ptdetail.phtml?Part=netclass9501-NO3&PreView=1

４.輸入完band後點上面紅色的"Count"，然後Dataset後面跑出的數字就是答案了...

我點出來的結果是 865 / 31,452 Genes，答案僅供參考XD

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這三個作業都是用PowerPoint做的，做完一樣寄到[e-mail]，信的title要註明

班級，姓名，學號，交的時間是禮拜四之前。

然後關於最後一個作業，小數點的部分我還不是很肯定，今天我去找老師的時候，他的門

著但是人已經消失了...如果錯了麻煩提醒一下，感謝！

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