作者Anvec ()
看板CSMU-LS89
標題Re: 問題 '___'?
時間Tue Apr 4 23:56:46 2006
※ 引述《goodman1 (帥哥皮 好人骨)》之銘言:
: 有一段話我看不懂啦 ><" 有沒有人可以幫我解釋一下的 囧rz
: A CpG island is defined as a 0.5-4kb long stretch of DNA with a G:C content>55%
: and an observed over expected frequency> 0.65.
: 最後面的an observed over expected frequency> 0.65是什麼意思啊?@@?
: 原文出處:Cellular Oncology 26 (2004) 291-9
: 謝謝大家 <(_ _)>
股溝無敵
http://alpha.life.nthu.edu.tw/~91a19/cpgplot.htm
The Observed number of CpG patterns in a window 即為 G nucleotide
緊接著 C nucleotide 出現的次數.
The Expected number of CpG patterns ( for each window ) 為根據 C
nucleotide 和 G nucleotide 在 window 出現的頻率, 所預期 CpG dinucleotides
在 window 中出現的次數. 所以, the Expected frequency of CpG's in a window
的計算為 C nucleotide window 中的數目乘上 G nucleotide 在 window 中的數目,
除以 window length.
然後兩者相除應該就是你想問的那句話的意義
不過我找到的多是為0.6
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 220.136.126.100
推 goodman1:謝謝瓜哥 ><" 可是我還是看不懂window的意思 '___'" 04/05 09:01
推 Anvec:吼 就是窗戶呀 04/05 15:09
→ Anvec:其實我也不了 04/05 15:09
推 goodman1:囧rz 那我原本的翻譯應該要怎麼翻譯會比較好啊 @@? 04/05 17:53
推 goodman1:? 04/07 00:42