作者TreeMan (好啊...)
看板Grad-ProbAsk
標題Re: [生醫] [生化]-關於合成DNA及Sanger定序法
時間Tue Feb 16 22:04:40 2010
※ 引述《super90579 (阿賢)》之銘言:
: 最近做到兩題覺得不太懂得..
: 1.In DNA sequencing by the Sanger methed:
: A)radioactive dideoxy ATP is included in each of four reaction mixtures
: before enzymatic synthesis of complementary strands
4個反應各自只加入ddATP, ddTTP, ddCTP, ddDTP
ddATP並不需要在4個反應都加入
而且在非自動型的定序中(即原版的Sanger method),ddNTP應該沒有radioactive...
: B)以特殊酵素將新合成的DNA切成小片段,並跑電泳來分離。
不需要,因為ddNTP會停止反應,形成各式的小片段,直接電泳分離即可
: C)the 雙去氧核苷酸 must be present at high levels to obtain long stretch
: of DNA sequence.
不可,過高的ddNTP會無法形成較長的片段
: D)the role of the dideoxy CTP is to occasionally terminate enzymatic
: synthesis of DNA where Gs occur in the template strands.
YES
: E)the template DNA strand is radioactive.
radioactive的是Snger method中的primer
: -------------------------------------------------------
: 2.在化學合成DNA中
: A)the dimethoxytrityl(DMT) group 會催化磷酸雙酯鍵的形成
應該是加入參予反應之dNTP其3'端diisopropylamino activating group
DMT是用來避免不必要的反應,是一個protective group
: B)合成的方向為5'向3'
3'-->5'
: C)合成oligonucleotide可以達到的最大長度為8-10個nucleotide.
通常70-80,可以更多
: D)the nucleotide initially attached to the silica gel support will become
: the 3'end of the finished product.
YES
: E)the protecting cyanoethyl groups are removed after each step.
在完成預定合成的鹼基數後才移除
: -------------------------------------------------------------
: 第一題小弟選D
: 而第二題就沒有頭緒了..
: 小弟翻書也找不到在哪裡有
: 敢問一下是在哪個單元提到的..?
: 謝謝!!
以上,請參考,第二題,如果你有L版生化課本,可以參考p295(5th)或核甘酸相關章節
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 61.230.115.157
噓 aki907:.....合成方向3'->5' 你真的讀過生化? 01/08 00:22
→ TreeMan:樓上是想成一般生物體DNA複製時的合成吧... 03/20 10:41
→ TreeMan:化學合成是反向的,你可以查我文章附的ref就知 03/20 10:41