問題解決了，我後來的方法一樣是使用signal的方式處理
只是在signal內部我又加了kill，大概是這樣寫的：
void sigfun (int sig)
{
//Close ttyS0
close(ttyfd);
//Kill
kill(getpid(), SIGQUIT);
}
這是我目前的作法，跟O大講的方式有些類似
不過我還是不瞭解何謂ISR是什麼東西
還請先進指點一下，謝謝
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