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要知道tumor cell會有不同的DNA mutation 分化得越不好,增生的越多,某些DNA就會大量表現轉錄以促進mitosis或抑制apoptosis 如p53, bcl-2等 而TMA就是將這些轉錄出來的mRNA用反轉錄酉每變成cDNA 再以特殊的marker呈色 只要tumor cell越多(積少成多)或一個tumor cell本身就可以大量表現 呈色就會越深 這就可以判斷這個tumor到了哪一個score 而你這份paper應該是講aquaporin5在大腸直腸癌中的表現量跟嚴重性的關係 小弟我才疏學淺(憑記憶打的,你的paper我好像不能download所以沒看@@) 希望有高人可以更詳細解釋^^ ※ 引述《ftsyice (Matt)》之銘言: : 我看到一篇文章,使用Tissue Microarray(TMA)分析他的樣本 : 有一句話是這麼說的 : TMAs was graded semiquantitatively considering both "staining intensity" : and "percentage of positive tumor cells" : 利用"staining intensity"和"positive tumor cells"來定義score的等級 : percentage of positive tumor cells : 我了解,是合理的區分方式 : 但是另一個staining intensity我就不了解其意思 : 字面上的意思是,染色的深淺度嗎? : 是與染色的時間有關係,還是與染色的效果有關係? : 這讓我胡塗了! 是否有神人能幫我解惑! : 文章裡的Staining intensity區分為 : score 0, No staining of cancer cell : score 1, weak staining : score 2, moderate staining : score 3, storng staining : 附上PAPER連結 : http://www.yousendit.com/download/TTZtaklpVnNqY29LSkE9PQ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 203.71.94.30
blence:這裡的TMA應該是看protein,如果要看RNA,作者只看單基因,1個 12/10 08:15
blence:96孔盤就搞訂,不需要大費周章做array 12/10 08:16
blence:RNA相關實驗容易定量,通常看到"呈色"實驗,就不會聯想到RNA 12/10 08:19
wchienkai:這篇paper是在TMA上做IHC看AQP protein expression 的. 12/10 22:23
ftsyice:TMA是同時做大量的IHC,比較Prrtein表現,用來連接臨床現象. 12/11 13:31
ftsyice:Score比較主觀,有人以metastasis,有人以invention來分級. 12/11 13:34
ftsyice:這篇是以Aquaporin5的表現來分級,關於如何分,有網友解答 12/11 13:36
ftsyice:是以相同步驟處理,然後染色程度顏色有深有淺,依此區分. 12/11 13:36
ftsyice:還是感謝以上的大大! 12/11 13:37