營業稅違章之處罰屬於行政罰的範圍。 而行政罰又可約略區分為行為罰與漏稅罰兩大類型，分別簡述如下：
(一) 行為罰：凡營業人單純的違反稅法上作為或不作為義務(違反禁止規定)，則僅課以
行為罰；簡言之，營業人違規行為未達漏稅階段所為之處罰，即所謂行為
罰。
(二) 漏稅罰：係以營業人有漏稅之事實為其要件而為之處罰。
如前所述，行為罰與漏稅罰課罰之要件不盡相同，其處罰之目的亦異。
故兩者非必為一事。然漏稅罰，通常與行為罰有其從屬關係，如觸犯營業稅法第45條規定
，未依規定申請營業登記而營業者之行為，而造成漏稅事實，則涉及營業稅法第51條第1
款規定之漏稅罰，係屬兩者具從屬關係之情形。而若觸犯營業稅法第52條規定，營業人漏
開統一發票或於統一發票上短開銷售額經查獲者，應就短漏開銷售額，按規定稅率計算稅
額繳納稅款外，處一倍至十倍罰鍰。一年內經查獲達三次者，並停止其營業。係以違章行
為有關之稅基(銷售額)或稅額(核定稅額)之一定比例為處罰標準。
ꘊ此種因個別作為義務之違反，即課以漏稅罰，屬營業稅法中的特例。
擇一從重處罰原則
租稅法行政罰之行為罰與漏稅罰，是否得併罰？抑或不得併罰？關係營業人至深
且鉅。自民國83年7月8日司法院大法官會議，釋字第356號解釋，採肯定說(得併罰)；而
後在民國84年8月18日行政法院判字第2043號判決，民國84年11月17日行政法院判字第
2862號判決及民國84年12月29日行政法院判字第3222號判決，均採否定說(不得併罰)。
迨於民國84年4月26日，財政部則以台財稅第851903313號函釋，納稅義務人同時觸犯行為
罰及漏稅罰，採「擇一從重」處罰原則，該原則遂成為營業稅課罰中最重要的基本原則。
所謂「擇一從重」處罰，係指營業人違反作為或不作為義務時，如同時亦構成
漏稅行為之一部或全部，且其處罰之種類，性質與目的相同者，應適用擇一從重處罰規定
。舉例如下：
1.營業人觸犯營業稅法第45條或46條，如同時涉及同法第51條各款者。
2.營業人觸犯營業稅法第51條各款，如同時涉及稅捐稽徵法第44條規定者。
3.營業人觸犯營業稅法第45條或46條，如同時涉及稅捐稽徵法第44條及營業稅法
第51條各款規定者。
4.營業人觸犯營業稅法第52條，如同時涉及稅捐稽徵法第44條規定者。
以上各例均採從重處罰，不再適用各有關法條之規定同時處罰。
自動補稅補報免罰之適用
營業人違反營業稅法規定，能獲得免除行為罰與漏稅罰，主要依據法源係為稅捐稽徵法
第48條之1。其要件為：
1.未經檢舉、未經稽徵機關或財政部指定之調查人員進行調查之案件。
2.納稅義務人自動向稅捐稽徵機關「補繳」並「補報」者。
3.補繳之稅款，應依郵政儲金匯業局之一年期定存利率，按日加計利息。
凡符合上述要件之營業人，以下之處罰一律免除；如涉及刑事責任者，亦得免除之。
1.稅捐稽徵法第41條，逃漏稅罪。
2.稅捐稽徵法第42條，違反代徵或扣繳義務罪。
3.稅捐稽徵法第43條，教唆或幫助逃漏稅罪。
4.稅捐稽徵法第44條，未給與取得及保存憑證之處罰。
5.稅捐稽徵法第45條，未設置記載及保存帳簿之處罰。
6.各稅法所定關於逃漏稅之處罰。
至於累積留抵稅額之營業人，其短漏報的應納稅額，是否可以適用稅捐稽徵法48條之1免
罰之規定，須視其各期留抵金額大小而定：
1.補繳之營業稅小於違章至申報或查獲日前，每期留抵稅額者：
(1)自動補申報者，免按營業稅法第51條規定處罰，免加計利息。
(2)經查獲者，免按營業稅法第51條規定處罰，惟稽徵機關將發單補徵應加計之利息
。
2.補繳之營業稅大於違章至申報或查獲日前，其中一期留抵稅額者：
(1)自動補繳差額、利息並補申報者，免按營業稅法第51條規定處罰。差額部分如未
補繳，該部分，則無法適用稅捐稽徵法48條之1規定。
(2)經查獲者，其差額部分即為漏稅額，應按營業稅法第51條規定處罰。
3.自違章至申報或查獲日前，其中一期有繳納應納稅額者：
(1)如在未經檢舉及未經稽徵機關或財政部指定之調查人員進行調查前，已自動補繳、
補報所漏稅額款者，可適用稅捐稽徵法48條之1，而免除稅捐稽徵法第44條及逃漏
稅處罰。
(2)經查獲者，其所漏稅額依營業稅法第51條規定處罰。
一、營業稅法規範之違章處罰，茲逐項說明如下：
(一)、未依規定申報營業登記之處罰
營業人未辦妥營業登記，而擅自營業，除通知限期補辦外，依其營業額大小，處罰情形如下：
1.未達營業稅起徵點，免使用統一發票者：
(1)行為罰：係依「裁罰倍數表」規定標準彙總如下：
(a)第一次通知者：處新台幣3000元(國幣1000元)罰鍰。
(b)第二次通知者：處新台幣15000元(國幣5000元)罰鍰。 (c)第三次及以後再通知者：
每次處新台幣30000元(國幣10000元)罰鍰。
逾期仍未補辦者，得連續處罰，直到辦妥營業登記為止。
(2)漏稅罰：每月銷售未達起徵點，無應納稅額，免罰。
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