推 yuwen930:我已經交出去了...殘念...0rz 11/19 10:19
各位同學
原來1.5版的是docking不出來的
我今天拿我用1.5版build model出來的structure
用1.6版的跑了4分多結果竟然東西進去了
不過分數低了點，但至少不像某人docking 28分鐘勒(嘿嘿)
不過總算都完成了
註：3DMA其實根本不用做的感覺
因為我用blast跑出來後，先把要做模版的跟要build model的sequence去做比對
之後再loading template的3D structure
就直接可build了，且分數根本就差不到哪裡
如果真的要的話，只要將template去做superimpose就差不多了
主要是看他們適不適合當template
最後verify 出來的分數根本沒什麼差，也將近是最高的期望值
如果我有地方說錯了，請指正
還有大家別再用1.5 docking了，是沒有結果的
但是docking出來的分數不是說很高，但至少進入活化位了
分數也是正值，我想這就夠了
有問題歡迎指教
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