推 hann7526:感謝小馬的經驗分享~(話說我還在自暴自棄不想動它orz) 12/04 21:00
→ sweethart:為什麼這樣就會得到序列呢?誰好心幫忙回答一下^^ 12/04 23:27
※ 引述《anna99713 (123456)》之銘言：
: 利用http://au.expasy.org/ 預測二級結構,:
: Method:
: Tools and software packages
: -->迳Secondary---進入-->
: (裡面有很多軟體可以預測二級結構,我選的是GOR,所以可以進行(1)的討論)
: GOR: 貼上CDS內轉譯出來的胺基酸序列
: (1) 和EMBOSS的GARNIER比對其結果是否相符?
: (2) 讀取以上的序列,看看是否有親親親親疏疏疏疏或是親疏親疏親疏的胺基酸序列:
: ^^^^^^^^任選一段就可以了(這時候就會發現二十個胺基酸的結構很重要...)
(1)例如:
EMBOSS:
序列:MAISTLTLTQSLYTRSFRPTIFFSSSSSSSFSCLCSSSSDCEPKLSVKKR
二級:HHHEEEECEEEEETTTTEETEEECCTTTTTTEETTTTTTTTHHHHHHHEE
SWISSPROT(GOR):
꜠オC:MAISTLTLTQSLYTRSFRPTIFFSSSSSSSFSCLCSSSSDCEPKLSVKKR
二級:ccccceeeeeeccccccccceeeccccccceeeeccccccccccccccce
(2)序列:L D A D A T
親疏: 疏親疏親疏親
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◆ From: 140.112.4.240