作者mzac1b (Goodday)
看板perl
標題[問題] 請問如何隨機截取一段序列?
時間Thu Mar 22 13:50:50 2007
各位大大好
小弟我最近在用perl 做氨機酸序列的分析
我學過的perl書只有 "begining perl for bioinformatics"
我想測試某個計分方式
對於 "指定的 motif"
與 "隨機挑選之序列" 是否有明顯的差異
請問:
如何從一群蛋白質序列 (約30000 個蛋白質序列)
由其中隨機挑選出任意一個蛋白質任意一段連續的短序列 ( ~30a.a. 的短序列)
我想挑選 5000 段隨機的短序列
請問這樣要怎麼寫
先感謝不吝賜教~~~
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.109.55.227
推 Andor:substr($dna, int(rand(length($dna)+1-30)), 30) 03/22 17:49
推 plankton:樓上正解 XDD 03/24 00:36
→ plankton:說真的我覺得 Learning perl 比 原PO說的那本書好用 03/24 00:38