Re: [問題] 藥物設計

[gascon (pp)]

※ 引述《superchris (Do best)》之銘言：
: ※ 引述《HIbaby (燃燒吧! 嗨~北鼻!)》之銘言：
: :   藥物設計上,  目前用到生物資訊的, 有成功的例子嗎?
: :   比方說預測蛋白質結構, 計算有效位置?
: :   不知道有沒有人聽到一些新的看法與資訊?
: 應該是沒有...........  或者說 藥廠 真的會相信嗎?
以前有聽老闆提過...
很多研究都是先設計一脫拉庫的藥物，再送測活性...
設計的方向可能是target在某個蛋白質或DNA位置
也許一開始目標是抗癌、降血糖...之類的
但測完發現沒活性就會轉篩其他活性 抗菌、抗發炎什麼的..
總之篩了n個結果後，挑幾個活性明顯來探討SAR...
這是以前發paper常做的事(俗稱亂槍打鳥)

最近幾年有開始做QSAR，利用電腦計算輔助設計
主要是針對已知藥物作用點的蛋白質進行模擬
分析的參數很多，3D結構、binding之類的...
目的就是想靠電腦來節省時間、金錢，開發有潛力的藥物


but
老闆說....
其實大部分的paper都還是跟以前一樣
做出一堆compound去篩活性
挑幾個結果漂亮的出來寫.....
再把最有活性的那個丟給電腦算出數據...
然後...paper就能寫的很好看
本末倒置的做法
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八卦是....我們老闆好像也......<囧>



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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) 
◆ From: 211.76.53.14
推 Highwind:如果算出來不好看怎麼辦?會修參數讓他變好看嗎?
推 lingon:基本上歐美大藥廠都有Computational screening unit
→ lingon:有出過各式各樣的algorithm來分析一個藥物跟目標的互動
→ lingon:最經典的設計藥物就是HIV protease inhibitor
→ lingon:除了本身藥物設計外,也有computational toxicology
→ lingon:來預測藥物可能的毒性(side-effect).
→ lingon:想對這方面有熟悉的了解請看nature drug discovry