作者consley (je ne sais quoi)
看板Python
標題[問題] 讀入字串之後搜索並列印該行
時間Sat Mar 19 16:20:43 2011
各位版大好 小弟最近剛開始學python 是透過putty連上unix
是有關基因序列的
我用raw_input讀入一字串
然後希望在字串中找到'>'並列印出該行文字(head)
然後再抓取下一行的基因序列進行後續處理
我的問題是要用何種語法找到'>'並列印出該整行?
然後如何再把下一行抓到另一個字串陣列裡進行後續處理?
或是各位高手有更好的處理方法 也請不吝指教
Example input:
>gi|123456|gb|NC_111.3|Homo sapiens silly sequence
AGGTGGCCAAAACTCGTCTT
Example output:
>gi|123456|gb|NC_111.3|Homo sapiens silly sequence
length:
G+C:
Entropy:
--
感謝大家指教
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 203.153.205.61
推 cobrasgo:你是指找到'>'之後,印出之後的所有字元嗎? 03/19 21:21
→ consley:對於'>'所在的該行是整行印出 但下一行的序列要單獨抓出來 03/19 21:46
→ consley:做其他計算 03/19 21:50
推 cobrasgo:如果是一個字串的話,應該a[a.index('>'):]就可以了 03/19 22:18
→ cobrasgo:家裡電腦沒灌python,上面這行也許語法有錯也不一定 03/19 22:19