[問題] 關於hypergeometric計算一問

[Godkin (山裡的人)]

[問題類型]:

經驗諮詢(我想用R 連接某些資料庫，請問大家的經驗)


[軟體熟悉度]:

使用者(已經有用R 做過不少作品)


[問題敘述]:

大家好，我在計算超幾何分配的機率分佈時遇到了一個問題:
首先, 我總共有24607顆球, 其中白球有1865顆, 黑球有22742顆
要算的是...現在我不放回抽了3460顆，其中至少有379顆白球的機率

在R底下我用的是phyper, python下我用的是stats.hypergeom.sf
但兩者算出的結果有點不同，請問我該相信哪一種方法算出來的結果?


[程式範例]:

R:
   1 - phyper(379-1,1865,22742,3460) = 7.993606e-15
Python:
   stats.hypergeom.sf(379-1,24607,1865,3460) = 7.96882090302e-15

奇怪的是, 如果我在phyper當中開啟log.p的設定:
   -phyper(379-1,1865,22742,3460,log.p=TRUE) = 7.968821e-15
就可以得到跟python一樣的結果, 請問為何會這樣?
*[m

[關鍵字]:

hypergeometric


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※ 文章網址: http://www.ptt.cc/bbs/R_Language/M.1416208463.A.59F.html
※ 編輯: Godkin (140.116.215.229), 11/17/2014 15:27:06
※ 編輯: Godkin (140.116.215.229), 11/17/2014 15:46:45
→ Wush978: 結果好像只差一點點, 可能是浮點數運算導致的不一致
推 bxxl: 看文件裡有沒有寫log.p代表什麼設定,感覺是approximation
推 bxxl: 可能是計算過程中,有沒有把機率變成log表示？
→ Godkin: log.p =>if TRUE, probabilities p are given as log(p).
→ Godkin: 用phyper比較慘的是-算抽到5704球,至少694顆白球的機率
→ Godkin: 用phyper的結果會變成0, 但是用python可以得到6.088e-46
→ Godkin: 不過加上log.p還有取負值, 結果就會跟python一樣了
→ gsuper: R在 10^-14 ~ 10^-22 的數字都不太可信
→ Carollax: 機率太小的話都要取log 否則在R裡會顯示0