※ 引述《honu (桶后的閃閃螢火蟲)》之銘言：
: Genome Sequences of Two SARS Virus Strains Confirmed
: http://www.sciam.com/article.cfm?articleID=000BFE14-7FC7-1EB1-BDC0809E
: C588EEDF&pageNumber=1&catID=1
(我都忘記科學人有中文版的，笨)
SARS冠狀病毒基因現形！
撰文╱王心瑩
近期在亞洲及其他一些地區肆虐的「嚴重急性呼吸道症候群」（SARS）已經在全
球快速奪走478條人命（到5月6日為止）。全球為了努力遏止SARS繼續傳播，大多數
的研究資訊都盡可能快速地公佈周知。科學家先前已經找出可能引發SARS病徵的元兇
，而世界各地的研究人員也各自進行基因定序的工作，台灣的台大醫院也在5月6日正
式公佈最新研究結果。目前確定有數種不盡相同的病毒基因組，5月1日《科學》期刊
便在其所屬的「科學快遞」網站上發表最早提出的兩篇論文。研究人員希望藉由了解
病毒的完整基因組，以及相關的蛋白質構造與特性，能夠更了解病毒的致病機制，進
而協助發展SARS的診斷方法、治療方法及疫苗的研發。
先前《新英格蘭科學期刊》已於4月10日於網路率先發表兩篇論文，兩個研究團隊均指
出，一種突變的冠狀病毒（coronavirus）應為引發SARS的元兇。冠狀病毒是一群具有
套膜的RNA病毒，其RNA約由30000個鹼基組成，為目前已知最大的RNA病毒之一。過去
認為冠狀病毒分為三大類，其中兩類會感染哺乳動物，另一類只感染飛禽，基本上這
類病毒的宿主相當專一，主要引發上呼吸道與腸道感染，然而此次引發SARS的冠狀病
毒似乎沒有這麼容易對付，行蹤飄忽難以掌控。
《科學》期刊5月1日發表的論文中，其中一篇是以加拿大卑詩省癌症機構基因科
學中心為首的研究團隊共同完成，他們也是全球第一個發表SARS冠狀病毒完整序列的
團隊，早在4月14日便將之放上網路。他們的檢體取自加拿大多倫多的一位病患，所
定序出的病毒命名為「多倫多株」（Tor2 strain），其基因組長度為29751個鹼基，
經系譜分析比對序列後，他們認為這個新種病毒與已知的三大類冠狀病毒均不甚相似
，不過與兩種人類的冠狀病毒HCoV-OC43和HCoV-229較為接近。加拿大團隊建議將這
類可能引發SARS病徵的冠狀病毒列為第四大類，稱為SARS-CoV。
加拿大團隊比較SARS-CoV與已知三類冠狀病毒的序列，並沒有發現太顯著的序列
互換，因此這個團隊推測，可能有某種未知宿主身上有未知種類的冠狀病毒，在近期
內發生小規模的突變，轉變成可以感染人類的種類；當然也可能是由原本對人類無害
的冠狀病毒突變而來。如果能夠找出突變前到底是哪一種冠狀病毒，那麼藉由比對兩
者序列的差異，以及研究宿主身上抗體的特性，或許可以盡快找到比較可靠的治療方
法與疫苗。
《科學》發表的另一篇文章是一個國際研究團隊共同完成，由美國疾病防制中心
（CDC）的羅塔（Paul A. Rota）領導，他們的樣本來自一位病逝於越南河內的病人，
取得其呼吸道檢體，而定出病毒的基因序列，基因組長度為29727個鹼基，含有11個
開放讀碼區（指可轉錄出一整段胺基酸列的段落）。他們將這種病毒命名為「厄巴尼
株」（Urbani strain），也確定這種病毒屬於冠狀病毒的一種。
國際團隊論文的共同作者之一、同屬CDC的歐貝斯提（Steven Oberste）說，他
們定出的病毒與「已知的冠狀病毒顯然是不同的」。這種病毒株的基因組整體構造，
與目前已知的三類冠狀病毒大致相同，不過進行系譜分析與序列比對後發現，某些特
定蛋白質的胺基酸序列有顯著的差異。歐貝斯提指出︰「這項新的分析雖已出爐，但
對於了解病毒起源幫助不大。」
確實，厄巴尼株與多倫多株雖然只有8個鹼基不一樣，但這些差異主要呈現在用來
複製遺傳物質的酵素上，並在外部形成不同的病毒套膜，也就是說，這些蛋白質是決
定病毒感染機制與途徑的關鍵角色，因此任何突變可能就會使得感染過程出現變化，
而各地病毒的些微差異也使感染途徑略有不同，因此病毒可能極易逃過藥物與疫苗的
攻擊，更增治療難度。
《科學》期刊也整理了截至4月29日為止的全球基因定序現況，除前述的厄巴尼
株與Tor2株之外，已定出完整序列的還包括香港大學發表的HKU-39849、香港中文大
學的CUHK-W1，以及新加坡基因體研究中心與新加坡綜合醫院共同發表的KYK。
台灣受到SARS波及嚴重，台大醫院也於5月6日發表台灣病患樣本的冠狀病毒定序
結果與相關研究。台大定出的病毒株命名為「台灣一號」（TW1），長度為29729個鹼
基，經序列比對發現，台灣一號與多倫多株最為相近，只相差3個鹼基，而與香港和
越南的病毒株差異稍大，相差約11~12個鹼基。由於現有的基因序列越來越多，彼此交
叉比對或許可以找出傳染途徑，甚至找出關鍵的蛋白質。台大是在4月9日由檢驗科主
任高全良首度成功培養病毒，並約在4月14日純化出病毒顆粒。他們也觀察到病人免疫
系統中的單核白血球有浸潤現象（即不正常蓄積），且病毒引發強烈的T細胞反應，產
生大量的細胞素（cytokine），使得巨噬細胞活性急速上升，甚至吞噬紅血球，而在
病患體內引發一連串致命的效應。
由於現今基因定序儀器與技術的高度普及，各個受到SARS嚴重威脅的國家莫不全
力進行各地病毒基因的定序工作。《科學》期刊在評論中特別以北京華大基因研究中
心為例，這個以定序出全球第一個稻米基因著稱的團隊急欲有所成績，但受限於中國
政府的步調無法施展，直到4月15日才拿到中國軍事醫學科學院提供的第一個樣本。
以他們嫻熟的技術，不出幾天就發表了BJ01、BJ02、BJ03、BJ04與GZ01等病毒株的部
份序列。
由於尋求SARS的治療方法日益迫切，加上相關傳言紛飛，不易判別真實程度，因
此位於日內瓦的國際衛生組織預計成立一個SARS基因多樣性資料庫（SARS genetic
diversity databank），結合臨床資料庫累積的資料，希望能統整資料，儘早找到可
行的方法。
【延伸閱讀】
「科學快遞」網站上可參考兩篇病毒基因定序的論文，以及數篇相關評論文章。
《新英格蘭醫學期刊》也於第一時間在網站上發表兩篇檢出冠狀病毒的論文。
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這個延伸閱讀原文精華區都有
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