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------------------------------------------------------------------------ [軟體程式類別]: R [程式問題]: Hierarchical Clustering [軟體熟悉度]: 高(1年以上) [問題敘述]: 小弟目前用大腸直腸癌病人甲基化的資料做 clustering。 我老闆希望圖長得像這樣:http://ppt.cc/XO7p 圖的出處是 "DNA methylation profiling reveals novel biomarkers and important roles for DNA methyltransferases in prostate cancer" published on Genome Research x軸是癌症/正常細胞,y軸是不同位點甲基化資料,對x軸做cluster, 頂端那些dendrogram要依照癌症/正常細胞分成藍色跟紅色, 試了幾個R常用的package都沒有發現類似的功能。 其實我也蠻好奇,當兩個細胞要合併成一組的時候, 如果一個是紅色,一個是藍色,那合在一起之後應該用那種顏色? 想請問版友有沒有畫過類似的圖,或是看過類似的paper。 如果有煩請告知小弟,不勝感激。 ----------------------------------------------------------------------------- -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 211.76.175.169
clickhere:?layout 把圖拆上下兩張,分開畫. 07/12 23:20
clickhere:藍+紅=?紫, 顏色得要自己改. 07/12 23:21
wwfc:謝謝c大的回覆。^^ 07/14 11:03