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year 2001
1.試述三種non-allopatric speciation process
2.試述 allopatric 和 peripatric 不同處
3.在Darwin提出theory of evolution 後，
試述classification和phylogeny之間的關係
4.試各用兩句話描述the 3 schools of macrotaxonomy
p.120
(一) Phenetics
Phenetics 學派學者的分類方法，主要是以 overall similarity 為依據。
他們相信這種分類方法，並不會違反共同祖先的理論，因為親緣愈近，理應相似性愈高。
(二) Cladistics
此學派企圖尋求各生物間的親緣關係，
藉由建構 cladogram(phylogenetic tree) 來呈現。
(三) Evolutionary classificatin
認為「Cladistics」並未能完全的顯現出 evolution 的各種情況。
他們一般採用兩階段方法：第一階段使用形態的相似性，建構初步的結果；
第二階段，則是以多種方法驗証各類是否 mono- phyletic 且 homogeneous。
5.同一群物種若有兩種分（歸）類結果，該如何選擇為佳？
6.試述何謂Linnaen hierarchy? 又科(family)的共同字尾為何?
在非正式場合，用何種名字稱呼屬於同一family的生物？
P.420
The hierarchical arrangement of categorical ranks for taxa in which each
category except the lowest includes one or more subordinate categories.
P.133
-idae
kind
7.請解釋何謂distance method 和 UPGMA
Distance method : numerical phenetics 的方法：性狀距離
UPGMA 是計算性狀 cluster 以建構 phenogram 樹狀圖用的方法。
Cluster 後新 taxon 的性狀是內含物種的算術平均值。
8.請解釋parsimony method和Wagner groundplan divergence method
The principle of parsimony: phylogeny of a group is inferred to be the
branching pattern requiring the smallest number of
evolutionary changes in character states.
9.請問cladistics 和evolutionary taxanomy 對data analysis的看法有何不同?
p.250
10.某高中生物課本有敘述如下：「古代魚類中某一種生物演化成兩生類，兩生類
中某些生物演化出爬蟲類，而爬蟲類中某些生物分別演化為鳥類和哺乳類」
試用monophyly, paraphyly, polyphyly觀念解釋以上敘述可能有什麼錯誤，
又試改寫此段課文，期使能字字符合Cladistics的概念。
以 cladistic 定義之 monophyletic taxon 必須符合包含所有分支 ex-group。
本文中並沒有指出「魚類包含兩生類」等分支現象，將兩生類等 taxon 自立門戶，
使魚類不符合 Monophyletic Taxon 的規則。如此則魚類因為沒有包含所有 ex-group，
成為 paraphyletic group。
而爬蟲與鳥類、哺乳類由「某些生物」演化而成，不符合 branching 必須由
單一 Species 來產生的原則。有可能是以爬蟲類指稱數種兩生類動物趨同演化
後形成的群體。不符合同一 taxon 必有單一祖先物種原則，使爬蟲類構成
polyphyletic taxon。鳥類、哺乳類以此類推。
Cladistics 認為 Daughter taxon 必須比 Mother Taxon 在分類層級上低一級。
year 2002
1.考圖9-2(p.215)
老師選出其中五個，劃底線，要求回答。但是他問什麼我已經忘了。
我印象中只記得其中兩個我寫了趨同演化。一個寫了逆轉演化？
另兩個寫了英文。
2.考數值分析
老師給出像圖11-5那樣的表格
要你算出彼此間的distance，填進剩下的空格，
然後畫出樹枝圖，樹枝圖必須表出彼此間的相近程度。。
老師上課時還強調，樹枝圖一定要向右對齊。
基本上上課有聽，就一定會。
算居離的方法，用的是平方和開根號的歐幾里德距離。
雖然是11章的圖，但是老師在第9章的時候應該有教。
3.考對於爬蟲類這個分類的概念。
印象中，老師在上課時畫了一張關於爬蟲類魚類鳥類的分支圖，
也包括了他們的分支點。裡面都是用英文的名詞。
基本上只要默寫出來那個圖應該就可以了。
不過我還畫蛇添足的加上了兩學派的不同看法。
如果你們也有抄這個圖，應該也是會考的。
4.老師給出五段靈長類動物的genome sequence，應該是同一種protein的sequence
其中一種為人類，然後從sequence的比較之中，
來試著判定其中兩種靈長類何者與人類在演化上的關係較接近。
如果上課沒教，應該就不會考了吧。
如果有教，原理很簡單，應該可以懂的。
以下是不確定的。
5.試述三種non-allopatric speciation process
這題好像跟考古題一樣，不過是第五章的。
6.試各用兩句話描述the 3 schools of macrotaxonomy
這題跟考古題一樣，有重出。
7.試述何謂Linnaen hierarchy? 又科(family)的共同字尾為何?
在非正式場合，用何種名字稱呼屬於同一family的生物？
這題也有重出。
8.請解釋何謂distance method 和 UPGMA
這題好像有重出。
重點是要弄清楚，兩種計算距離的方式有何不同。
一種是利用重心來求，另一種不是。
上課有聽就會，老師也許有另外發講義。
9.請問cladistics 和evolutionary taxanomy 對data analysis的看法有何不同?
這題好像有重出。
10.圖11-16
記得是要懂的這個圖的意義，加以解說。
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