作者JosephX (Joseph)
看板bioinfo_lab
標題Re: [問題] 請教生醫資料探勘問題
時間Tue May 2 12:02:03 2006
我做成投影片 如果想看圖請給我信箱我寄給你
基本上就是利用400次的permutation test 同時計算 P(g, c*) = r
可以畫出一個近似常態分布的密度函式 (作業四就是要這個)
接著就可以決定每個基因在 1%, 5% 與 median在其各自密度函式中的臨界 r
就這樣得到7129個基因各自的臨界 r (我設成 rk1, rk5, rkm of the kth gene)
然後只需要根據所需的significant level (如 1%)統計它的總量,
如有多少基因的 ri1 > 0.5 , for i = 1~7129
就可以畫出1%的那條曲線
同理就可求 5% 與 median 那兩條
※ 引述《Zing119 (哈哈)》之銘言:
: 各位好我是陳小明研究室的學生
: 想請教也有修陳倩瑜老師"生醫資料探勘"那堂課的幾位學長
: 請問leukemia那篇reading paper中
: fig.2 圖中,permuted 1% 5% median那三條曲線是如何產生的??
: 用作業的方式 只能找出原本p(g,c)位於permutation結果多少%的位置呀??
: 抱歉上課沒聽清楚
: 請學長指點!
: 感謝!!
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 219.91.77.28
推 Zing119:謝謝學長!!! 05/02 16:21
推 agomi:學長好帥~ 學長我也要認識可愛的妹妹~~ 05/03 01:04
推 JosephX:那有什麼問題,但不列入此次考試範圍。。 05/03 17:14