強大なる力を秘めるという「賢者の石」を求めて、旅を  けるエルリック兄弟。

兄のエドワードは、弱冠15歲ながら史上最年少で國家鍊金術師の資格を得た、天才鍊金
術師。

弟のアルフォンスは、見た目は屈強な鎧姿だが、心優しい14歲の少年である。

東部邊境の町、リオールにやってきた二人は、そこで太陽神レトの代理人を名乘る、
コーネロ教主の「奇跡の御業」を目擊するが…。