請問在ligation時~我們要怎麼知道"鈍端"接的對不對呢~~

[CEFCA (啦啦啦)]

我的意思是~~
例如~ATCGAAAAA是正確的~~
     TAGCTTTTT

但卻接成TAGCTTTTT
        ATCGAAAAA

這樣DAN會表現嗎~~
如果這一段是promoter~~會有影響嗎~
還是說這樣根本接不起來呢~~

那如果一邊沒有接錯~
但DAN另一邊卻扭轉了好幾次又接回正確的~
這樣扭轉的結構會影響DNA表現嗎~

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