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標 題: [問題]請問有關蛋白質序列第二層結構有何資料可讀嗎?
發信站: 元智大學風之塔 (Sun Jul 23 22:58:13 2000)
轉信站: Ptt!bbs.ee.ntu!freebsd.ntu!news.neto.net!db.csie.ncu!news.ncu!news.yzu
各位大家好 , 我是成大的研究生 , 由於不是有關背景畢業的
所以對許多有關蛋白質的知識都不懂 , 由其對於第二層結構 (Secondary structure)
的 a-Helix 與 Beta-sheet 及Loops 基本知識不甚了解 , 僅能從少許的 paper上
去了解 , 但paper都過於專研於某一部份 , 是否有專門介紹或研究此簡單基礎的書ꤊ
或論文呢 ? 基本上如何從一段蛋白質序列中去分辨為 a-Helix 或 Beta-sheet
或 Loops 呢 ? 請善心人士提供我資料的搜尋方向 , 謝謝 !!
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※ Origin: 元智大學 風之塔 <bbs.yzu.edu.tw>
※ From : 140.116.86.108
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發信人: gohks.bbs@MSIA.pine.ncu.edu.tw (狂牛症=prion！？), 看板: Biology
標 題: Re: [問題]請問有關蛋白質序列第二層結構有何資料可讀嗎?
發信站: 大馬同學會 大紅花的國度 (Mon Jul 24 00:40:04 2000)
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【 在 bz.bbs@bbs.yzu.edu.tw (你袂了解.....) 的大作中提到: 】
: 各位大家好 , 我是成大的研究生 , 由於不是有關背景畢業的
: 所以對許多有關蛋白質的知識都不懂 , 由其對於第二層結構 (Secondary structure)
: 的 a-Helix 與 Beta-sheet 及Loops 基本知識不甚了解 , 僅能從少許的 paper上
: 去了解 , 但paper都過於專研於某一部份 , 是否有專門介紹或研究此簡單基礎的書ꤊ: 或論文呢 ? 基本上如何從一段蛋白質序列中去分辨為 a-Helix 或 Beta-sheet
: 或 Loops 呢 ? 請善心人士提供我資料的搜尋方向 , 謝謝 !!
生化課本上應該都會介紹a-Helix ， Beta-sheet
或 Loops的氨基酸組成。
像apha-Helix可以由polyleusine或polyalanine等所構成（希望沒說錯）。
這些二級結構主要關係到旁基的性質，
如果知道序列應該可以推算出大概的二級結構，
這也要看蛋白質本身的複雜程度。
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發信人: gwchin.bbs@bbs.ntu.edu.tw (), 看板: Biology
標 題: Re: [問題]請問有關蛋白質序列第二層結構有何資料可讀嗎?
發信站: 台大計中椰林風情站 (Tue Jul 25 11:28:39 2000)
轉信站: Ptt!bbs.ee.ntu!Palmarama
Secondary structure is a special field of computational biology.
Please ask more specifically.
Some web sites may help you:
http://www.bork.embl-heidelberg.de/SSCP/
http://jura.ebi.ac.uk:8888/
http://searchlauncher.bcm.tmc.edu:9331/pssprediction/pssp.html
Happy webbing
==> bz.bbs@bbs.yzu.edu.tw (你袂了解.....) 提到:
> 各位大家好 , 我是成大的研究生 , 由於不是有關背景畢業的
> 所以對許多有關蛋白質的知識都不懂 , 由其對於第二層結構 (Secondary structure)
> 的 a-Helix 與 Beta-sheet 及Loops 基本知識不甚了解 , 僅能從少許的 paper上
> 去了解 , 但paper都過於專研於某一部份 , 是否有專門介紹或研究此簡單基礎的書ꤊ> 或論文呢 ? 基本上如何從一段蛋白質序列中去分辨為 a-Helix 或 Beta-sheet
> 或 Loops 呢 ? 請善心人士提供我資料的搜尋方向 , 謝謝 !!
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發信人: echo01.bbs@bbs.ntu.edu.tw (貓跟著音符舞著~), 看板: Biology
標 題: Re: [問題]請問有關蛋白質序列第二層結構有何資料可讀嗎?
發信站: 台大計中椰林風情站 (Tue Jul 25 11:35:50 2000)
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==> bz.bbs@bbs.yzu.edu.tw (你袂了解.....) 提到:
> 各位大家好 , 我是成大的研究生 , 由於不是有關背景畢業的
> 所以對許多有關蛋白質的知識都不懂 , 由其對於第二層結構 (Secondary structure)
> 的 a-Helix 與 Beta-sheet 及Loops 基本知識不甚了解 , 僅能從少許的 paper上
> 去了解 , 但paper都過於專研於某一部份 , 是否有專門介紹或研究此簡單基礎的書ꤊ> 或論文呢 ? 基本上如何從一段蛋白質序列中去分辨為 a-Helix 或 Beta-sheet
> 或 Loops 呢 ? 請善心人士提供我資料的搜尋方向 , 謝謝 !!
有一本粉貴的書"Introduction to protein structure"
書不在手邊，藍色封面，很多結構的圖畫的蠻精緻的，
也是各老師推薦念蛋白質結構必念的書。
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發信人: analine.bbs@bbs.ntu.edu.tw (吹sax..玩jazz), 看板: Biology
標 題: Re: 請問有人使用質譜儀測蛋白質序列的嗎？
發信站: 台大計中椰林風情站 (Fri Sep 1 11:56:55 2000)
各位大家好 , 我是成大的研究生 , 由於不是有關背景畢業的
所以對許多有關蛋白質的知識都不懂 , 由其對於第二層結構 (Secondary structure)
的 a-Helix 與 Beta-sheet 及Loops 基本知識不甚了解 , 僅能從少許的 paper上
去了解 , 但paper都過於專研於某一部份 , 是否有專門介紹或研究此簡單基礎的書ꤊ
或論文呢 ? 基本上如何從一段蛋白質序列中去分辨為 a-Helix 或 Beta-sheet
或 Loops 呢 ? 請善心人士提供我資料的搜尋方向 , 謝謝 !!
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標 題: Re: [問題]請問有關蛋白質序列第二層結構有何資料可讀嗎?
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【 在 bz.bbs@bbs.yzu.edu.tw (你袂了解.....) 的大作中提到: 】
: 各位大家好 , 我是成大的研究生 , 由於不是有關背景畢業的
: 所以對許多有關蛋白質的知識都不懂 , 由其對於第二層結構 (Secondary structure)
: 的 a-Helix 與 Beta-sheet 及Loops 基本知識不甚了解 , 僅能從少許的 paper上
: 去了解 , 但paper都過於專研於某一部份 , 是否有專門介紹或研究此簡單基礎的書ꤊ: 或論文呢 ? 基本上如何從一段蛋白質序列中去分辨為 a-Helix 或 Beta-sheet
: 或 Loops 呢 ? 請善心人士提供我資料的搜尋方向 , 謝謝 !!
生化課本上應該都會介紹a-Helix ， Beta-sheet
或 Loops的氨基酸組成。
像apha-Helix可以由polyleusine或polyalanine等所構成（希望沒說錯）。
這些二級結構主要關係到旁基的性質，
如果知道序列應該可以推算出大概的二級結構，
這也要看蛋白質本身的複雜程度。
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標 題: Re: [問題]請問有關蛋白質序列第二層結構有何資料可讀嗎?
發信站: 台大計中椰林風情站 (Tue Jul 25 11:28:39 2000)
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Secondary structure is a special field of computational biology.
Please ask more specifically.
Some web sites may help you:
http://www.bork.embl-heidelberg.de/SSCP/
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http://searchlauncher.bcm.tmc.edu:9331/pssprediction/pssp.html
Happy webbing
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> 各位大家好 , 我是成大的研究生 , 由於不是有關背景畢業的
> 所以對許多有關蛋白質的知識都不懂 , 由其對於第二層結構 (Secondary structure)
> 的 a-Helix 與 Beta-sheet 及Loops 基本知識不甚了解 , 僅能從少許的 paper上
> 去了解 , 但paper都過於專研於某一部份 , 是否有專門介紹或研究此簡單基礎的書ꤊ> 或論文呢 ? 基本上如何從一段蛋白質序列中去分辨為 a-Helix 或 Beta-sheet
> 或 Loops 呢 ? 請善心人士提供我資料的搜尋方向 , 謝謝 !!
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標 題: Re: [問題]請問有關蛋白質序列第二層結構有何資料可讀嗎?
發信站: 台大計中椰林風情站 (Tue Jul 25 11:35:50 2000)
轉信站: Ptt!bbs.ee.ntu!Palmarama
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> 各位大家好 , 我是成大的研究生 , 由於不是有關背景畢業的
> 所以對許多有關蛋白質的知識都不懂 , 由其對於第二層結構 (Secondary structure)
> 的 a-Helix 與 Beta-sheet 及Loops 基本知識不甚了解 , 僅能從少許的 paper上
> 去了解 , 但paper都過於專研於某一部份 , 是否有專門介紹或研究此簡單基礎的書ꤊ> 或論文呢 ? 基本上如何從一段蛋白質序列中去分辨為 a-Helix 或 Beta-sheet
> 或 Loops 呢 ? 請善心人士提供我資料的搜尋方向 , 謝謝 !!
有一本粉貴的書"Introduction to protein structure"
書不在手邊，藍色封面，很多結構的圖畫的蠻精緻的，
也是各老師推薦念蛋白質結構必念的書。
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發信人: analine.bbs@bbs.ntu.edu.tw (吹sax..玩jazz), 看板: Biology
標 題: Re: 請問有人使用質譜儀測蛋白質序列的嗎？
發信站: 台大計中椰林風情站 (Fri Sep 1 11:56:55 2000)