※ 引述《drling.bbs@bbs.ntu.edu.tw (Jessie the Cat)》之銘言:
> 我想請問有關DNA array方面的問題
> 不知道哪位好心的人士可以告訴我
> 1.Nylon array
> 2.Glass array
> 3.Oligonucleotide array
> 三者的原理、應用以及不同點
> 謝謝
目前已發展的基因晶片(DNA chip or gene chip)可分為兩類,一類即為
cDNA微陣列晶片。另一類是利用類似半導體製成中之照相平版印刷
(photolithography)的方式,配合光化學反應將所欲製成(或已知序列)之
DNA 核?酸(nucleotides)一層層的往上鋪疊接合而成。每一層鋪疊之前
皆必須製作四個不同的光罩,其打洞位置在經由抽換此四光罩時,
分別讓A、T、C、G四種核?酸鑲嵌於每層不同之位置內。利用此一
原理製作而成之晶片,其價格昂貴,且因核?酸序列愈長誤差率愈大
的關係,每片約僅做25個鹼基(base)的長度,即約需製作100個不同之
光罩。
cDNA微陣列大致上是根據南方墨點(Southern blot)的方法,將由mRNA
經反轉錄(reverse transcription)所得的cDNA(target)與另一DNA(probe)作用
(probe與target定義與南方墨點法相反),藉以觀察基因的表現。然而,
微陣列是將DNA probe利用機械手臂點印於經由特殊塗膜(coating)之玻片上,
一片玻片點印最大容量可達上萬,並以螢光染劑(fluorescent dye)取代
放射性同位素,在mRNA進行反轉錄成cDNA的同時將螢光染劑標定
於cDNA (target)上。我們利用probe與target之中核?酸互補配對的關係
進行配對接合(hybridization)反應。之後並利用雷射掃瞄系統掃瞄玻片,
配對成功的cDNA將被雷射光激發而放出螢光。因此,我們可藉由快速
的量測並分析玻片發出的螢光強度,同時檢測大量基因的表現以及
其間可能存在之相關性表現。
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※ Origin: 楓橋驛站<bbs.cs.nthu.edu.tw> ◆ From: Juno.ns.nthu.edu.tw
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發信人: c675461.bbs@bbs.nchu.edu.tw (沒有退路了), 看板: Biology
標 題: Re: 有關DNA aaray?
發信站: 興大天樞資訊網 (Sat Jun 3 01:10:39 2000)
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==> 在 [Saunter.bbs@bbs.cs.nthu.edu.tw] 文中提到:
: nt
: ※ 引述《drling.bbs@bbs.ntu.edu.tw (Jessie the Cat)》之銘言:
: > 我想請問有關DNA array方面的問題
: > 不知道哪位好心的人士可以告訴我
: > 1.Nylon array
: > 2.Glass array
: > 3.Oligonucleotide array
: > 三者的原理、應用以及不同點
: > 謝謝
: 目前已發展的基因晶片(DNA chip or gene chip)可分為兩類,一類即為
: cDNA微陣列晶片。另一類是利用類似半導體製成中之照相平版印刷
: (photolithography)的方式,配合光化學反應將所欲製成(或已知序列)之
: DNA 核?酸(nucleotides)一層層的往上鋪疊接合而成。每一層鋪疊之前
: 皆必須製作四個不同的光罩,其打洞位置在經由抽換此四光罩時,
: 分別讓A、T、C、G四種核?酸鑲嵌於每層不同之位置內。利用此一
: 原理製作而成之晶片,其價格昂貴,且因核?酸序列愈長誤差率愈大
: 的關係,每片約僅做25個鹼基(base)的長度,即約需製作100個不同之
: 光罩。
: cDNA微陣列大致上是根據南方墨點(Southern blot)的方法,將由mRNA
: 經反轉錄(reverse transcription)所得的cDNA(target)與另一DNA(probe)作用
: (probe與target定義與南方墨點法相反),藉以觀察基因的表現。然而,
: 微陣列是將DNA probe利用機械手臂點印於經由特殊塗膜(coating)之玻片上,
: 一片玻片點印最大容量可達上萬,並以螢光染劑(fluorescent dye)取代
: 放射性同位素,在mRNA進行反轉錄成cDNA的同時將螢光染劑標定
: 於cDNA (target)上。我們利用probe與target之中核?酸互補配對的關係
: 進行配對接合(hybridization)反應。之後並利用雷射掃瞄系統掃瞄玻片,
: 配對成功的cDNA將被雷射光激發而放出螢光。因此,我們可藉由快速
: 的量測並分析玻片發出的螢光強度,同時檢測大量基因的表現以及
: 其間可能存在之相關性表現。
而Nylon array乃是中研院生醫所白果能老師利用打點機將cDNA直接點漬在
Nylon membrane並摒棄玻璃與oligonucleotide所利用的螢光成色法,而結合類似
ELISA方式的 Enzyme Linked Multi-Color Detection來成色