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※ 引述《drling.bbs@bbs.ntu.edu.tw (Jessie the Cat)》之銘言: > 我想請問有關DNA array方面的問題 > 不知道哪位好心的人士可以告訴我 > 1.Nylon array > 2.Glass array > 3.Oligonucleotide array > 三者的原理、應用以及不同點 > 謝謝 目前已發展的基因晶片(DNA chip or gene chip)可分為兩類,一類即為 cDNA微陣列晶片。另一類是利用類似半導體製成中之照相平版印刷 (photolithography)的方式,配合光化學反應將所欲製成(或已知序列)之 DNA 核?酸(nucleotides)一層層的往上鋪疊接合而成。每一層鋪疊之前 皆必須製作四個不同的光罩,其打洞位置在經由抽換此四光罩時, 分別讓A、T、C、G四種核?酸鑲嵌於每層不同之位置內。利用此一 原理製作而成之晶片,其價格昂貴,且因核?酸序列愈長誤差率愈大 的關係,每片約僅做25個鹼基(base)的長度,即約需製作100個不同之 光罩。 cDNA微陣列大致上是根據南方墨點(Southern blot)的方法,將由mRNA 經反轉錄(reverse transcription)所得的cDNA(target)與另一DNA(probe)作用 (probe與target定義與南方墨點法相反),藉以觀察基因的表現。然而, 微陣列是將DNA probe利用機械手臂點印於經由特殊塗膜(coating)之玻片上, 一片玻片點印最大容量可達上萬,並以螢光染劑(fluorescent dye)取代 放射性同位素,在mRNA進行反轉錄成cDNA的同時將螢光染劑標定 於cDNA (target)上。我們利用probe與target之中核?酸互補配對的關係 進行配對接合(hybridization)反應。之後並利用雷射掃瞄系統掃瞄玻片, 配對成功的cDNA將被雷射光激發而放出螢光。因此,我們可藉由快速 的量測並分析玻片發出的螢光強度,同時檢測大量基因的表現以及 其間可能存在之相關性表現。 -- ※ Origin: 楓橋驛站<bbs.cs.nthu.edu.tw> ◆ From: Juno.ns.nthu.edu.tw > -------------------------------------------------------------------------- < 發信人: c675461.bbs@bbs.nchu.edu.tw (沒有退路了), 看板: Biology 標 題: Re: 有關DNA aaray? 發信站: 興大天樞資訊網 (Sat Jun 3 01:10:39 2000) 轉信站: Ptt!bbs.ee.ntu!freebsd.ntu!ctu-peer!ctu-gate!news.nctu!ccnews.nchu!new ==> 在 [Saunter.bbs@bbs.cs.nthu.edu.tw] 文中提到: : nt : ※ 引述《drling.bbs@bbs.ntu.edu.tw (Jessie the Cat)》之銘言: : > 我想請問有關DNA array方面的問題 : > 不知道哪位好心的人士可以告訴我 : > 1.Nylon array : > 2.Glass array : > 3.Oligonucleotide array : > 三者的原理、應用以及不同點 : > 謝謝 : 目前已發展的基因晶片(DNA chip or gene chip)可分為兩類,一類即為 : cDNA微陣列晶片。另一類是利用類似半導體製成中之照相平版印刷 : (photolithography)的方式,配合光化學反應將所欲製成(或已知序列)之 : DNA 核?酸(nucleotides)一層層的往上鋪疊接合而成。每一層鋪疊之前 : 皆必須製作四個不同的光罩,其打洞位置在經由抽換此四光罩時, : 分別讓A、T、C、G四種核?酸鑲嵌於每層不同之位置內。利用此一 : 原理製作而成之晶片,其價格昂貴,且因核?酸序列愈長誤差率愈大 : 的關係,每片約僅做25個鹼基(base)的長度,即約需製作100個不同之 : 光罩。 : cDNA微陣列大致上是根據南方墨點(Southern blot)的方法,將由mRNA : 經反轉錄(reverse transcription)所得的cDNA(target)與另一DNA(probe)作用 : (probe與target定義與南方墨點法相反),藉以觀察基因的表現。然而, : 微陣列是將DNA probe利用機械手臂點印於經由特殊塗膜(coating)之玻片上, : 一片玻片點印最大容量可達上萬,並以螢光染劑(fluorescent dye)取代 : 放射性同位素,在mRNA進行反轉錄成cDNA的同時將螢光染劑標定 : 於cDNA (target)上。我們利用probe與target之中核?酸互補配對的關係 : 進行配對接合(hybridization)反應。之後並利用雷射掃瞄系統掃瞄玻片, : 配對成功的cDNA將被雷射光激發而放出螢光。因此,我們可藉由快速 : 的量測並分析玻片發出的螢光強度,同時檢測大量基因的表現以及 : 其間可能存在之相關性表現。 而Nylon array乃是中研院生醫所白果能老師利用打點機將cDNA直接點漬在 Nylon membrane並摒棄玻璃與oligonucleotide所利用的螢光成色法,而結合類似 ELISA方式的 Enzyme Linked Multi-Color Detection來成色