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SciScape 新聞 (http://leos.bu.edu/)
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[Jun 16, 00] 偵測基因表現的最新有力工具：MPSS
隨著人類基因計畫的進行，我們對於基因的序列有更多的掌握。對生物科技界來說，下一個挑戰，便在於正確偵測基因的表現程度。怎樣在速度和正確性之中得到一個平衡 ? 在六月的Nature Biotechnology中，Sydney Brenner的研究團隊發表了一個名之為MPSS的新工具，或許正是提供解答的生物新技術。
研究人員一直在尋找一個測量基因表現的最好方法，然而，一直以來他們面對著研究方法的兩難。DNA晶片是快速而方便的一個技術，卻被它有限的敏感度所限，而使用PCR來偵測基因表現相對來說較可信賴，卻因需要跑大量的電泳而需花費較多的金錢、時間和人力。最近Sydney Brenner和他的同事將這兩種方式合併在一起，發明了被取名為「微球狀陣列」(Microbead Array)的新技術，使我們能夠在複製數以千計的基因碎片之同時，亦進行被稱之為「多重性平行定序」(Multiple parallel signature sequencing，簡稱MPSS) 的快速分析。
MPSS可被分為兩個步驟。首先，一個基因複本的DNA被黏至十分微小的微球體上，然後，在第二個步驟裏，我們利用基因庫的資料，比對辨認這些黏在微球體上的DNA。由此，藉由微球體的數目，我們便可以輕易地找出該基因被表現的程度。問題是，我們應該怎樣辨認特定的基因呢? Brenner團隊利用了螢光和限制酵素的知識，成功地發展出一套辨認基因末端16對鹼基對的方法。這16對鹼基對的辨認便使我們有能力決定酵母菌的基因體中所有的基因。
MPSS這個最新的技術，不但和目前廣被使用的技術有同等的正確性，在人類白血球上的實驗更說明它的錯誤率極小。此外，MPSS可以偵測到極為罕見的基因表現，並同時對基因體中所有基因的表現程度，提供一個統計上的數字指標。有了這樣的工具，我們就能夠對細胞中因應不同外在環境而有所不同基因表現，有更深一步的認識和了解，它不但為生物晶片技術開啟了一扇新的門窗，亦為分子生物學及人類基因計畫的研究提供了有力的工具。
--編譯自:
Nature Biotechnology
<http://www.nature.com/nbt/press_release/nbt0600.html>
-- 責任編輯: YPChang <ypchang@uclink4.berkeley.edu>