請教版上曾經做過CHIP的高手
做了好久的CHIP最後在PCR階段遇到了困難
input有出現band但是非常微弱
其他IP下的DNA根本就沒有訊號
參考paper利用RNA Pol II當positive control
但是也P不到東西
後來覺得可能是DNA品質不好所以測了OD 260/280
發現只要是IP下來的DNA ratio都非常低 大概只有1.0左右
input比較好大概1.5左右
我是利用phenol/chloroform/isoamyl alcohol做DNA純化
每次都很小心不要取到有機層
但是出來的ratio還是很差
請問是不是因為DNA品質的關係所以PCR跑不出來？
如果是的話有哪個步驟要小心才能使DNA ratio提高呢？
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