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PCR產物拿去跑膠 結果產量很少...只看到微弱的band 但是在100bp的地方卻有一條很亮的band 不知道到底是什麼 是primer嗎..primer大小才20nt...而且...EtBr應該沒辦法插入吧 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.116.192.254 > --------------------------------------------------------------------------- < 作者 wensing (煉金術:等價交換) 看板 Biotech 標題 Re: 請問一個關於PCR的問題 時間 Fri Dec 17 23:42:41 2004 ─────────────────────────────────────── ※ 引述《stancy (又變回學生樣)》之銘言: : PCR產物拿去跑膠 : 結果產量很少...只看到微弱的band : 但是在100bp的地方卻有一條很亮的band : 不知道到底是什麼 : 是primer嗎..primer大小才20nt...而且...EtBr應該沒辦法插入吧 不是primer 可能是亂黏所致 -- wensing (ptt) = eular (kkcity) -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 203.73.252.105 > --------------------------------------------------------------------------- < 作者 key () 看板 Biotech 標題 Re: 請問一個關於PCR的問題 時間 Sat Dec 18 00:31:32 2004 ─────────────────────────────────────── ※ 引述《stancy (又變回學生樣)》之銘言: : PCR產物拿去跑膠 : 結果產量很少...只看到微弱的band : 但是在100bp的地方卻有一條很亮的band : 不知道到底是什麼 : 是primer嗎..primer大小才20nt...而且...EtBr應該沒辦法插入吧 primer dimer primer(s) 自己或彼此黏 當然 polymerase一樣能作用把單股的地方加長補齊 過了個cycle 又denature 這個已經變長的其中一股 當然也可以跟primer互補 所以又繼續反應 因此 會合成一些短短的dsDNA 我們通常直接叫 primer dimer -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 219.84.20.245 > --------------------------------------------------------------------------- < 作者 stancy (又變回學生樣) 看板 Biotech 標題 Re: 請問一個關於PCR的問題 時間 Sat Dec 18 12:08:08 2004 ─────────────────────────────────────── ※ 引述《key ()》之銘言: : ※ 引述《stancy (又變回學生樣)》之銘言: : : PCR產物拿去跑膠 : : 結果產量很少...只看到微弱的band : : 但是在100bp的地方卻有一條很亮的band : : 不知道到底是什麼 : : 是primer嗎..primer大小才20nt...而且...EtBr應該沒辦法插入吧 : primer dimer : primer(s) 自己或彼此黏 : 當然 polymerase一樣能作用把單股的地方加長補齊 : 過了個cycle 又denature 這個已經變長的其中一股 當然也可以跟primer互補 : 所以又繼續反應 : 因此 會合成一些短短的dsDNA 我們通常直接叫 primer dimer 所以問題是出在primer的設計囉? -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.116.192.254
key:主要是 或是你的溫度設定條件等因素 140.109.89.86 12/18
koykey:但primer dimer並不一定會影響PCR 140.109.89.86 12/18
koykey:意思就是說 不用急著換primers 多試試吧^^ 140.109.89.86 12/18
> --------------------------------------------------------------------------- < 作者 ccdd.bbs@bbs.ccns.ncku.edu.tw (................), 看板 Biotech 標題 Re: 請問一個關於PCR的問題 時間 夢之大地 (Sat Dec 18 16:02:13 2004) 轉信 ptt!Group.NCTU!grouppost ─────────────────────────────────────── ※ 引述《stancy.bbs@ptt.cc (又變回學生樣)》之銘言: > ※ 引述《key ()》之銘言: > : primer dimer > : primer(s) 自己或彼此黏 > : 當然 polymerase一樣能作用把單股的地方加長補齊 > : 過了個cycle 又denature 這個已經變長的其中一股 當然也可以跟primer互補 > : 所以又繼續反應 > : 因此 會合成一些短短的dsDNA 我們通常直接叫 primer dimer > 所以問題是出在primer的設計囉? 應該不是 因為每次跑PCR多多少少都會在最底下看到primer的影子 這跟pimer的設計應該沒有太大的關係 -- ︵︵ █▔◣ █▔█ █▔▔ █▔█ █▆▉ █ █▔█ █◣█ █▔ █◣︵︵ █ █ █▁◤ █▁▁ █▁█ ▉▉▉ █ █▁█ █◥█ █ █ 夢之大地 逼逼ㄟ四 █▁◤ █ █ █▁▁ █ █ ▉▉▉ █▁ █ █ █ █ █▁◤ ※ Origin: <bbs.ccns.ncku.edu.tw> ◆ From: 140.116.94.59 > --------------------------------------------------------------------------- < 作者 Anemos (寶寶) 看板 Biotech 標題 Re: 請問一個關於PCR的問題 時間 Sun Dec 19 10:49:13 2004 ─────────────────────────────────────── ※ 引述《ccdd.bbs@bbs.ccns.ncku.edu.tw (................)》之銘言: : ※ 引述《stancy.bbs@ptt.cc (又變回學生樣)》之銘言: : > 所以問題是出在primer的設計囉? : 應該不是 : 因為每次跑PCR多多少少都會在最底下看到primer的影子 : 這跟pimer的設計應該沒有太大的關係 primer dimer本來就是常常會出現 只是或多或少 而且也當然是越少越好 不過跟primers的設計真的有很大的關係 如果認為不是primers設計的問題 那建議你可以試試縮短上機前的配製時間 而且冰上操作 以前我也遇過primer dimer的問題 因為我一次做太多管 那個時候的配製又不是太熟練流利 所以用掉太多時間 後來聽老師的建議 全程冰上操作 一但開始配製master mixture就必須在十分鐘內上機跑 之後就很少看到嚴重的primer dimer了 So可以試看看改進自己的操作過程 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.117.191.32
key:推冰上操作 手工的hot start喔~ 省錢好用 219.84.20.245 12/19
stancy:有可能是我技術不熟練..謝謝喔..我再試試 140.116.193.170 12/23