請問一下
要如何分析DNA序列中的polymorphism?
如果不用軟體分析
要如何從序列中判斷wild type, heterozygous, homozygous?
請大家幫幫忙 我找了很久找不到相關的資料
感激不盡~~~
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 63.231.50.80
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作者: isdorothy (小蚜虫) 看板: Biotech
標題: Re: [問題]請問polymorphism...
時間: Mon May 2 03:31:12 2005
去NCBI的BLAST玩看看@@
※ 引述《squinel (something wrong)》之銘言：
: 請問一下
: 要如何分析DNA序列中的polymorphism?
: 如果不用軟體分析
: 要如何從序列中判斷wild type, heterozygous, homozygous?
: 請大家幫幫忙 我找了很久找不到相關的資料
: 感激不盡~~~
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夏天出生的小孩呀..
http://www.wretch.cc/user/isdorthy
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◆ From: 59.104.200.54
> -------------------------------------------------------------------------- <
發信人: [email protected] (到頭來只是個墻外行人), 看板: Biotech
標 題: Re: [問題]請問polymorphism...
發信站: 無名小站 (Mon May 2 15:06:38 2005)
轉信站: ptt!Group.NCTU!grouppost!Group.NCTU!wretch
※ 引述《[email protected] (小蚜虫)》之銘言：
> 去NCBI的BLAST玩看看@@
這也是軟體分析吧...
> ※ 引述《squinel (something wrong)》之銘言：
> : 請問一下
> : 要如何分析DNA序列中的polymorphism?
> : 如果不用軟體分析
> : 要如何從序列中判斷wild type, heterozygous, homozygous?
眼睛看?! Orz
> : 請大家幫幫忙 我找了很久找不到相關的資料
> : 感激不盡~~~
對不起 沒回到你要的
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夫兵者不祥之器物或惡之故有道者不處君子居則貴左用兵則貴右兵者不祥之器非君子
之器不得已BBS telnet://bbs.wretch.cc 開個人板 超快 不用連署不可得志於天下
矣吉事尚左凶事尚右偏將軍居左上將軍居右言以喪禮處之殺人之眾以哀悲泣之戰勝以
喪禮處之道常無名樸雖小天下莫能臣侯王若能守之萬物將自賓天地相合以降甘露民莫
之令而自均始制有名名亦既有夫亦將知止知止可以不殆譬道之在天 140.109.40.39海
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發信人: [email protected] (TheOne), 看板: Biotech
標 題: Re: [問題]請問polymorphism...
發信站: 無名小站 (Tue May 3 13:45:07 2005)
轉信站: ptt!Group.NCTU!grouppost!Group.NCTU!wretch
如果是要看點突變的話，可以利用PolyBayes 這個軟體，
http://genome.wustl.edu/groups/informatics/software/polybayes/
或者是利用polyphred 這個軟體，
http://droog.mbt.washington.edu/PolyPhred.html
pubmed link:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=9207020
如果是insertion 和 deletion 的話，polyphred 也可以偵測。
※ 引述《[email protected] (something wrong)》之銘言：
> 請問一下
> 要如何分析DNA序列中的polymorphism?
> 如果不用軟體分析
> 要如何從序列中判斷wild type, heterozygous, homozygous?
> 請大家幫幫忙 我找了很久找不到相關的資料
> 感激不盡~~~
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夫兵者不祥之器物或惡之故有道者不處君子居則貴左用兵則貴右兵者不祥之器非君子
之器不得已BLOG http://www.wretch.cc/blog 安西教練 我想寫日記 嗚嗚o志於天下
矣吉事尚左凶事尚右偏將軍居左上將軍居右言以喪禮處之殺人之眾以哀悲泣之戰勝以
喪禮處之道常無名樸雖小天下莫能臣侯王若能守之萬物將自賓天地相合以降甘露民莫
之令而自均始制有名名亦既有夫亦將知止知止可以不殆譬 mutant.cs.nthu.edu.tw海