[問題] protein marker以及SDS-PAGE的band

[bluecsky (我要藍藍淡淡的天空)]

最近在跑SDS-PAGE有一些疑惑

我知道SDS-PAGE所跑出的是denature的狀態的protein

所以跑出的位置是protein被denature的狀態下的分子量..應該對吧

所以這有沒有可能表示...

這跟我用軟體計算的原本分子量(一般計算應該都是算native的吧)

這之中是有誤差的..可能大或是小..

所以這麼說的話..跑SDS-PAGE使用protein marker不就相當沒有意義嗎?

因為跟本無法得知是否是真確的

有請高手幫我解惑..

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上帝曾經說過 :
        當一個人打你右臉的時候
                        你就要用日耳曼背橋摔壞它的左臉

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◆ From: 140.109.57.139
推 tsubasawolfy:蛋白質修飾的問題?
推 sunorange:denature後的大小就是你所謂的軟體算出來的大小
→ sunorange:沒有denature的話 出來的大小會因為一些修飾
→ sunorange:看起來 大小和算出來的不一樣
推 bluecsky:所以一般軟體算的原來是denature的阿
→ bluecsky:原來如此..我沒考慮到修飾的問題
推 ermine:和蛋白質的mobility也有關係吧?
→ ermine:此外 也有protein在SDS-PAGE中無法"完全"denatured的情況