※ 引述《bluecsky (我要藍藍淡淡的天空)》之銘言：
: 最近在跑SDS-PAGE有一些疑惑
: 我知道SDS-PAGE所跑出的是denature的狀態的protein
: 所以跑出的位置是protein被denature的狀態下的分子量..應該對吧
: 所以這有沒有可能表示...
: 這跟我用軟體計算的原本分子量(一般計算應該都是算native的吧)
: 這之中是有誤差的..可能大或是小..
: 所以這麼說的話..跑SDS-PAGE使用protein marker不就相當沒有意義嗎?
: 因為跟本無法得知是否是真確的
: 有請高手幫我解惑..
使用軟體計算出的分子量在不管醣化或是其他post-modification的作用下...
所得的分子量是正確的...
跑SDS-PAGE使用marker的意義在於幫助你找到蛋白可能出現的位置...
並不是說膠上所對應的位置就一定是某蛋白...
也不能確認是否有其他分子量相同的雜蛋白出現在該位置...
唯一去確認的方式是作identification...
不管是mass或是NMR...
就像是你某個實驗控制到一定的精準程度後...
你不用跑marker也會知道蛋白會出現在哪...不是嗎...
當然你也不能確定你的蛋白有100% denature...
而PAGE的解析受限於shape以及mass...
當然在準確度上就有盲點...
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