Re: [問題] protein marker以及SDS-PAGE的band

不是修飾與否的問題

當然蛋白質的後修飾會造成理論值跟實際值的差異

但是原 po 問的是SDS 跑出來的結果是否 "幾乎必然" 跟計算不同

原 po 所持的理由是

 "計算出來的是 native form 的分子量"

 但

 "SDS PAGE 跑出來的是 denature 的分子量"

上面的理由有有一個基本上的錯誤：

試問 "native form 的分子量" 跟 "denatured form 的分子量" 有何不同？

在 SDS PAGE 中，所謂 denature 指的是蛋白質二級以上結構的喪失

二級以上結構喪失會影響分子量嗎？

或者反過來想
當我們計算一蛋白質的理論分子量的時候 可曾需要考慮二級以上結構的影響嗎？

簡而言之 不管有沒有 denature, 分子量本身是不會變的

會變的是實驗的結果能否正確反應其分子量

在蛋白質電泳中 若不 denature 則反而不能反映正確的分子量
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And my soul from out that shadow that lies floating on the floor
  在那地板上浮動的影子中的我的靈魂

                Shall be lifted- nevermore!
                  將永不再起...
                                          --The Raven by E.A.Poe
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※ Origin: 生命科學 BBS <bbs.life.nthu.edu.tw> 
◆ From: cpe-66-61-25-1.neo.res.rr.com
推 chvkimo:換句話說:SDS-PAGE denature是要去除結構所造成電泳的影響
推 boblu: 然也