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最近做實驗遇到一個問題, 想問問看版上有沒有人可以給些建議。 就是我把兩個 vectors 送進 E. coli, 各帶了個 protein (兩個 proteins 不一樣) 希望兩個可以一起 express... 一個是在 pRSET vector 裡, 另一個是跟別的實驗室要的,他們自己做的, 是在 pMON 裡,用的是 Ptac promoter。 我試了兩種,BL21(DE3) 和 BL21(DE3)pLysS, 可是在 BL21(DE3),用 pRSET 的看起來沒有 express; 用 pLysS 的時候,換成 pMON 的那個沒有 express。 但是如果只送進一個 vector 的話, 在兩種 strain 都會 express... 會不會 co-expression 的量比較少, 所以用 SDS-PAGE 看不出來? 有什麼方法可以知道到底有沒有 express 呢? 我的做法是 co-transform 2 vectors into E coli, set up O/N culture; next day, inoculate into 25ml LB induced with 1mM (and 0.5mM) IPTG when OD=0.6 at 37C for 3hrs with shaking. run on SDS-PAGE to check expression. 我用 BL21(DE3) 試了 30C 和加 glucose, 可是 pRSET 的那個 expression 好像沒有改善, 看起來沒有 express... 不知道有什麼方法可以改善這個情形, 讓兩個 protein 一起 express... (在不換 vector 的情況下) 換 e. coli strain 可行嘛? 可是 pRSET 好像只能在 BL21(DE3) or BL21(DE3)pLys 這種裡面有帶 T7 RNA polymerase 的 strain 裡。 還是有什麼其他的 strain 可以試, 或其他可以改善 expression 的方法呢? 有點長,先謝謝您耐心看完。 --   夢想和現實是有距離的。   一切都將重新開始.... -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 207.216.223.62
ptthamutaro:1.確定都可以表現(各自) 2.確定有送進去 140.136.247.245 01/25
ptthamutaro:3.兩者表現時間一致? 140.136.247.245 01/25
> --------------------------------------------------------------------------- < 作者 oplz (oplz) 站內 Biotech 標題 Re: [問題] 想請教一下關於 protein expression 時間 01/25/2005 17:02:05 Tue ─────────────────────────────────────── 我對你提到的 plasmid 沒甚麼概念, 不過我的建議是可以檢查一下兩種 plasmid 的 origin (OriV) 在 E.coli 中, 兩種 plasmid 若使用同樣的 OriV, 會造成互相競爭, 最後只有其中一種會留下來. 在這種情況下, 理論上如果多挑幾個菌, 兩種單獨表現某種 protein 的 strain 應該都可以挑到 如果你手上也是這樣的情形, 那就很可能是兩種 plasmid 使用了同一個 OriV 的緣故. 大部分的 high copy number plasmid 使用的 oriV 應該都是同一種, oriV(ColE1) <- 印象中 有錯請更正. 也就是 pBluescript or pET 這些 vector 所用的 origin, ~200 copy/cell FYI. -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 134.174.178.197 > --------------------------------------------------------------------------- < 作者 [email protected] (alenhsia), 看板 Biotech 標題 Re: [問題] 想請教一下關於 protein expression 時間 批踢踢參 (Wed Jan 26 10:33:11 2005) 轉信 ptt!Group.NCTU!grouppost ─────────────────────────────────────── ※ 引述《[email protected] (DREAMCHASER)》之銘言: : 最近做實驗遇到一個問題, : 想問問看版上有沒有人可以給些建議。 : 就是我把兩個 vectors 送進 E. coli, : 各帶了個 protein (兩個 proteins 不一樣) : 希望兩個可以一起 express... : 一個是在 pRSET vector 裡, : 另一個是跟別的實驗室要的,他們自己做的, : 是在 pMON 裡,用的是 Ptac promoter。 : 我試了兩種,BL21(DE3) 和 BL21(DE3)pLysS, : 可是在 BL21(DE3),用 pRSET 的看起來沒有 express; : 用 pLysS 的時候,換成 pMON 的那個沒有 express。 你有check兩個plasmids都有進到e. coli中嗎? 你是用不同的抗生素篩選的嗎? 另外,兩個不同的plasmids是用不同的ori嗎?一個e coli只會複製一種 ori...也就是說如果你兩個plasmids是用同一種ori的話,只有一個會被 e coli複製....也就只能表現一個plasmid了... -- ※ 發信站: 批踢踢參(ptt3.cc) ◆ From: 129.85.146.169 > --------------------------------------------------------------------------- < 作者 ad1980 (DREAMCHASER) 看板 Biotech 標題 Re: [問題] 想請教一下關於 protein expression 時間 01/26/2005 15:57:25 Wed ─────────────────────────────────────── : e coli複製....也就只能表現一個plasmid了... 我是用不同抗生素,一個是 Amp,一個是 Kan。 我是在 LB/Amp/Kan plate 上挑過再做 expresssion 的。 兩個是不一樣的,一個是 ColE1,一個是 p15A。 這樣照理說應該是可以一起表現的吧.... 為什麼不行呢?....~~>.<~~ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 207.216.223.62 > --------------------------------------------------------------------------- < 作者 [email protected] (alenhsia), 看板 Biotech 標題 Re: [問題] 想請教一下關於 protein expression 時間 批踢踢參 (Thu Jan 27 09:12:05 2005) 轉信 ptt!Group.NCTU!grouppost ─────────────────────────────────────── ※ 引述《[email protected] (DREAMCHASER)》之銘言: : ※ 引述《[email protected] (alenhsia)》之銘言: : : 你有check兩個plasmids都有進到e. coli中嗎? : : 你是用不同的抗生素篩選的嗎? : : 另外,兩個不同的plasmids是用不同的ori嗎?一個e coli只會複製一種 : : ori...也就是說如果你兩個plasmids是用同一種ori的話,只有一個會被 : : e coli複製....也就只能表現一個plasmid了... : 我是用不同抗生素,一個是 Amp,一個是 Kan。 : 我是在 LB/Amp/Kan plate 上挑過再做 expresssion 的。 : 兩個是不一樣的,一個是 ColE1,一個是 p15A。 : 這樣照理說應該是可以一起表現的吧.... : 為什麼不行呢?....~~>.<~~ 你有用western測試一下嗎...包括supernatant 與pallette.... 我覺得可能有兩的原因... 第一 你這兩個plasmids的copy number與 promoter強度是相近的嗎... 有可能某一個plasmid的copy number太多或promoter太強造成兩個蛋白質ꨠ 差異很大 第二 由沒有可能其中一個蛋白質變成inclusion body.....所以你還要要用 western check一下pallette... Good luck -- ※ 發信站: 批踢踢參(ptt3.cc) ◆ From: 129.85.146.169