一、 目的、組成元件、功能比較：
◎醫院：單就系統方面而言，醫院是協助民眾解決健康照護的問題，滿足民眾醫療需求的場所，使病患成為健康的人。就醫療資訊系統(HIS)而言，其目的在結合各項電腦、醫療檢查及通信設備，將醫療與醫院行政作業程序自動化，以提升病患就醫便利，進而降低醫院管理成本，提高醫院效率與效能，簡單來說，是為了節省人力資源，提高工作效率之目的而開發。醫院又可細分成許多系統，由最基層的作業層次系統→知識層次系統→管理層次系統→策略層次系統。『作業層次系統』是支援日常醫療活動，即有效率的完成每天例行的掛號、診療、收費、撥補…等活動，服務對똊H為基層主管；『知識層次系統』是作業層次資料的分析彙總，是日常管理活動安排的重要依據，提供資訊的對象就是整合作業層次彙總性資料的人員。EX：財務人員協助醫院整合會計資訊進行書面流程控制；『管理層次系統』提供資訊服務的對象只要是部門主管，協助其行政管理活動及督導、控制、決策；『策略層次系統』應用的對象是高階主管，主要應用於較長程、有關組織目標、政策、計畫的活動。
醫院內部有：教學研究、醫療服務、檢驗檢查影像儲傳、行政管理、醫療服務等部門。
◎診所：診所的目的是位達到病患就醫可近性、便利性，並和較具規模的醫療機構做連結，落實轉診制度，可藉以控制醫療資源的浪費和節省民眾就醫等待時間。診所：主要有醫師、護理人員、藥劑師，提供正常醫療活動。
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