[討論] 困惑已久的問題

[goodman1 (黃金單身漢)]

今天上完課後又更不懂了

siRNA跟RNAi到底差在哪裡？＠＠？

siRNA, miRNA又差在哪？   Orz

RNAi是指一個現象還是一個「東西」？

上網去看，越看問號越多   = ="
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剛考完試的會不會比較清楚啊？ 可以麻煩解說一下或介紹網頁嗎？＠＠？

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生與死，起源與終點，生命的意義為何，從哪裡來，往哪裡去
  是相信有一位造物主容易，還是相信一切事物原本就理所當然地存在容易
信就是所望之事的實底，未見之事的確據；然而我們不過都是憑著信心，無知地活著
  每個人都會死，但是很少人願意認真地把它當一回事，總認為它還離我們很遠
如果死後有神的審判，那麼很多人都要傷腦筋了；如果沒有，身為基督徒倒也不吃虧

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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) 
◆ From: 163.15.161.234
推 zodac:http://kuso.cc/1Xr  請慢用
推 Anvec:RNAi是一種 process
推 Anvec:siRNA 是 antisense的 RNA
→ Anvec:可是有時候會對 Transgene發生 RNAi的現象
→ Anvec:而 Normal gene活得很快樂
推 Anvec:miRNA可以 self-complementation會形成 stem-loop
→ Anvec:然後就忘光了 嗯
推 greenglass:抱歉，goodman1是誰阿??精華區找不到??
推 hipper:中山醫的魔鬼筋肉好人....建毅
推 otina:沒+啊.....>_<"
推 goodman1:為什麼阿水會知道我高中的綽號...  = ="
推 hipper:我是大師 掐指一算 就知道了.....XD
推 sGoat:請參閱基八
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作者: greenglass (喝) 看板: CSMU_LS89
標題: Re: [討論] 困惑已久的問題
時間: Wed May 18 20:30:51 2005

※ 引述《goodman1 (黃金單身漢)》之銘言：
: 今天上完課後又更不懂了
: siRNA跟RNAi到底差在哪裡？＠＠？
: siRNA, miRNA又差在哪？   Orz
: RNAi是指一個現象還是一個「東西」？
: 上網去看，越看問號越多   = ="

siRN跟RNAi應該一樣吧!?

miRNA與siRNA相似的地方包括：同樣是小分子RNA，同樣需要RNase-III enzyme-Discer
的切剪，同樣需要靠著與RISC的結合才有作用。

相異的地方包括有：來源不同，miRNA主要是轉譯自Genome DNA，而siRNA主要則是靠著
切剪dsRNA而來的。基因干擾的方式也不同，miRNA所引發的RNA interference是靠著不
完美的結構loop與mRNA結合而阻斷mRNA 的轉錄，siRNA所引發的RNA interference
主要是靠著切剪mRNA序列而抑制基因表現。 但是，也有少數paper 指出部份miRNA
也是靠著切剪mRNA而達到基因表現抑制作用，比如miR196 & Hoxb8 之間的關係。
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剛好最近在看相關paper，希望有幫到忙!!

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◆ From: 61.230.25.135
推 hipper:呵呵 這就是溫馨的班版呀...^^
推 hipper:古德曼一號 你沒出來答謝NO哥...
→ goodman1:太感動啦～太感謝了～拜謝<(_ _)> 偽小綠是好人
→ goodman1:生科版，就甘心
推 sGoat:請參閱基八
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作者: sGoat (無三小羚羊) 看板: CSMU_LS89
標題: Re: [討論] 困惑已久的問題
時間: Thu May 19 22:39:09 2005

※ 引述《goodman1 (黃金單身漢)》之銘言：
: 今天上完課後又更不懂了
: siRNA跟RNAi到底差在哪裡？＠＠？

siRNA是RNAi的其中一種作用機制...

si所指的small interference...
small-->> 21-25個nt

那麼有macro interference RNA嗎??
剛開始發現RNAi機制的人都以為要有完整的antisense template...
才能啟動RNAi的機制...
但是後來證實只要有21-25個nt就可以作用...
那麼長片段的RNAi機制會發生嗎??
不知道...因為這方面的發現還不夠多...

: siRNA, miRNA又差在哪？   Orz

miRNA是自然界中發現的情形...
siRNA是模仿miRNA作用的機制...

: RNAi是指一個現象還是一個「東西」？

RNAi是種現象...
由於RNA(外來或是自己產生的)干擾本體基因表現的現象...

: 上網去看，越看問號越多   = ="

基八裡面324頁有滿詳細的講解...
當你感到困擾時,最好的解決方式是去找一本textbook來看...
如果找不到...那可能是找的不夠多...或是方法不對...
網路的東西最好當成最後的手段...
因為那不會比textbook中的定義來的確切...

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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) 
◆ From: 140.120.130.14
推 goodman1:因為我在實驗室沒有自己的位子
→ goodman1:所以書沒地方放...Orz 老闆的書也不外借，so...
→ goodman1:所以遇到問題就是MSN求救，或上網找資料 ＠＠
→ goodman1:不過常常還是看不太懂 （理解力很差） Orz
→ goodman1:總之還是謝謝了 <(_ _)> 肛溫啊～各位大大～
推 sGoat:@.@a"  我還以為你有位置了...
推 jerris:miRNA應該叫microRNA吧 還是我搞錯你的意思?.?
推 sGoat:是micro沒錯阿...怎??
推 goodman1:妳好像打成macro了？＠＠？<---塔大師這樣對嗎ꄠ
推 sGoat:我這裡指的macro是指"巨"...不是指miRNA的micro
推 jerris:i see  ^__^
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作者: zzfly (蒼蠅) 看板: CSMU_LS89
標題: Re: [討論] 困惑已久的問題
時間: Fri May 20 01:45:28 2005


因為最近剛好上 journal club 有回答此問題，
所以順便補充一下（以上小羚羊講的都對）


miRNA=microRNA
主要來源是從 endogenous transcripts形成幾百個 nucleotide 的 hairpin結構
在核內經 Drosha 這個酵素切割形成70-90nt的 miRNA hairpin precursor
由核膜上的 exportin-5 運送至細胞質，最後經 Dicer 切割成21-23nt的miRNA
經 RISC 將 miRNA 配對至植物 mRNA 的 coding region 或 UTR 造成 mRNA cleavage
而動物中則是發現會配對至 mRNA 3'UTR 造成 translation attenuation

siRNA 的來源是 viral RNAs 或人工合成送入的 dsRNA經 Dicer切割成 21-25nt
經 RISC 去完全配對於相對應 mRNA 造成 mRNA cleavage

另外還有一種 rasiRNA = repeat-associated siRNA
是由 centromic repeat 或 satellite DNA 轉錄後，
因為這些區域的序列都是高度重複性的序列，所以很有機會形成相配對 dsRNA
再經 Dicer 切割形成 rasiRNA 經 RITS (RNA-induced transcriptional silencing)
complex 帶到 centromere 或 satellite DNA 處並招募一些蛋白結合和
修飾 DNA 和 histone 使染色質結構更緊密形成 heterochromatin



相關 paper 可從 review 下手
或者直接打關鍵字從 google 找圖片，然後再進一步連結至圖片來源的paper
以上資料就是我用這種方式找到的





RNAi果然是門深奧的學問


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◆ From: 203.203.163.37
推 hipper:真是不錯 一些潛水的同學 都浮上來了...^^
推 Anvec:請問 journal club是什麼? 期刊夜總會? +_+a
→ goodman1:期刊研究社？我大學時學長有想辦過說可惜流標了
推 zzfly:兩個實驗室合辦的.不參加都不行....
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作者: ligase (真的不是距離嗎) 看板: CSMU_LS89
標題: Re: [討論] 困惑已久的問題
時間: Sat May 21 01:04:51 2005

附帶一提
有人現在再做siRNA的嗎

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◆ From: 192.192.228.178
推 hipper:晉鳴以前好像有玩過.....