請問一個生化上遇到的問題

[kindtaco (kindtaco)]

在TCA cycle中有一個中間產物succinate
再生化課本裡她的第一個碳跟第二個碳都有一個星星
代表說他是從acetyl CoA 上得來的碳
但是我覺得很奇怪
succinate不是對稱的分子嗎
那為什麼沒有經過特別標定也可以確定那是從acetyl CoA上得來的



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◆ From: 140.116.143.115
推 zzxxzz:有圖嗎?
→ kindtaco:http://0rz.tw/191XV 只有分子名稱 沒有分子結構式
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作者: ast154251 (臺中地頭蛇N￾NNNＩ 看板: Chemistry
標題: Re: 請問一個生化上遇到的問題
時間: Tue Oct 10 02:07:07 2006

※ 引述《kindtaco (kindtaco)》之銘言：
: 在TCA cycle中有一個中間產物succinate
: 再生化課本裡她的第一個碳跟第二個碳都有一個星星
: 代表說他是從acetyl CoA 上得來的碳
: 但是我覺得很奇怪
: succinate不是對稱的分子嗎
: 那為什麼沒有經過特別標定也可以確定那是從acetyl CoA上得來的

當初在確定這件事情時
研究者確實有特別標定(例如把H換成D)
因此確定是從哪裡來的

然後赫然發現這樣一個對稱分子
在生物體中其實是不對稱的
因為在這個循環裡的前一個對稱分子─檸檬酸
形成時有兩個CH2COO-基團，一個新的一個舊的
而它的前驅物草醋酸沒有特定的光學活性
故理論上新的CH2COO-加在左邊或右邊都可以
那如果有的加左邊有的加右邊，是不是就分不清楚哪個是新的
但是，因為酵素是對掌的
所以只能從同一邊加
這就造成兩個CH2COO-有顯著的不同
之後的路徑也就都差別處理了

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我們努力地工作，就是使人類能用真理對抗命運

                                    -卡繆-

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推 kindtaco:謝謝妳的解答~~
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作者: kindtaco (kindtaco) 看板: Chemistry
標題: Re: 請問一個生化上遇到的問題
時間: Tue Oct 10 15:04:50 2006

※ 引述《ast154251 (臺中地頭蛇N￾NNNＩ》之銘言：
: ※ 引述《kindtaco (kindtaco)》之銘言：
: : 在TCA cycle中有一個中間產物succinate
: : 再生化課本裡她的第一個碳跟第二個碳都有一個星星
: : 代表說他是從acetyl CoA 上得來的碳
: : 但是我覺得很奇怪
: : succinate不是對稱的分子嗎
: : 那為什麼沒有經過特別標定也可以確定那是從acetyl CoA上得來的
: 當初在確定這件事情時
: 研究者確實有特別標定(例如把H換成D)
: 因此確定是從哪裡來的
: 然後赫然發現這樣一個對稱分子
: 在生物體中其實是不對稱的

就是這裡覺得很奇怪 因為單看分子結構式
不是會覺得怎嚜翻轉都是一樣的嗎~??
那為什麼它可以確定在左邊的就是來自acetyl CoA呢
對不起我比較笨有點看不太懂



: 因為在這個循環裡的前一個對稱分子─檸檬酸
: 形成時有兩個CH2COO-基團，一個新的一個舊的
: 而它的前驅物草醋酸沒有特定的光學活性
: 故理論上新的CH2COO-加在左邊或右邊都可以
: 那如果有的加左邊有的加右邊，是不是就分不清楚哪個是新的
: 但是，因為酵素是對掌的
: 所以只能從同一邊加
: 這就造成兩個CH2COO-有顯著的不同
: 之後的路徑也就都差別處理了



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推 arlix:用同位素標定 ex C14
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作者: ast154251 (臺中地頭蛇N￾NNNＩ 看板: Chemistry
標題: Re: 請問一個生化上遇到的問題
時間: Tue Oct 10 17:12:45 2006

※ 引述《kindtaco (kindtaco)》之銘言：
: ※ 引述《ast154251 (臺中地頭蛇N￾NNNＩ》之銘言：
: : 當初在確定這件事情時
: : 研究者確實有特別標定(例如把H換成D)
: : 因此確定是從哪裡來的
: : 然後赫然發現這樣一個對稱分子
: : 在生物體中其實是不對稱的
: 就是這裡覺得很奇怪 因為單看分子結構式
: 不是會覺得怎嚜翻轉都是一樣的嗎~??
: 那為什麼它可以確定在左邊的就是來自acetyl CoA呢
: 對不起我比較笨有點看不太懂

不是「左邊的來自Acetyl-CoA」
而是「把來自Acetyl-CoA的那兩個碳畫在左邊」

: : 因為在這個循環裡的前一個對稱分子─檸檬酸
: : 形成時有兩個CH2COO-基團，一個新的一個舊的
: : 而它的前驅物草醋酸沒有特定的光學活性
: : 故理論上新的CH2COO-加在左邊或右邊都可以
: : 那如果有的加左邊有的加右邊，是不是就分不清楚哪個是新的
: : 但是，因為酵素是對掌的
: : 所以只能從同一邊加
: : 這就造成兩個CH2COO-有顯著的不同
: : 之後的路徑也就都差別處理了

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