日本時代初期的辨務署(中文應作辦務署，惟日文作"辦"為"辨")肇始於1897年5月3日
公布之台灣總督府地方官官制，該官制規定在縣廳之下設置辨務署，而在該年6月10日
所公布之辨務署名稱及位置如下(各辨務署之位置以括弧註明，而各辦務署之管轄區域
本文暫略)：
台北縣
台北辨務署(台北城內) 士林辨務署(芝蘭一堡士林街) 新庄辨務署(興直堡新庄街)
三角湧辨務署(三角湧街) 景尾辨務署(景尾街) 桃仔園辨務署(桃仔園街)
中壢辨務署(中壢街) 滬尾辨務署(滬尾街) 樹林口辨務署(樹林口街)
基隆辨務署(基隆街) 水邊腳辨務署(水邊腳街) 頂雙溪辨務署(頂雙溪街)
金包里辨務署(金包里街)
台北縣下共設13辨務署
新竹縣
新竹辨務署(新竹城內) 北埔辨務署(北埔街) 新埔辨務署(新埔街)
頭份辨務署(頭份街) 苗栗辨務署(苗栗街) 苑裡辨務署(苑裡街)
大甲辨務署(大甲街)
新竹縣下共設7辨務署
台中縣
台中辨務署(藍興堡台中城內) 南投辨務署(南投堡南投街) 葫蘆墩辨務署(葫蘆墩街)
犁頭店辨務署(犁頭店街) 牛馬頭辨務署(牛馬頭街) 大肚辨務署(大肚中堡大肚街)
彰化辨務署(彰化城內) 和美線辨務署(和美線街) 鹿港辨務署(馬芝堡鹿港街)
二林辨務署(二林下堡二林街) 北斗辨務署(東螺西堡北斗街) 社頭辨務署(武東堡社頭街)
員林辨務署(燕霧下堡員林街) 埔里社辨務署(埔里社堡埔里社城內)
集集辨務署(集集堡集集街)
台中縣下共設15辨務署
嘉義縣
蕭壟辨務署(蕭壟堡蕭壟街) 六甲辨務署(赤山堡六甲街)
中埔辨務署(嘉義東堡中埔庄) 梅仔坑辨務署(梅仔坑街)
打貓辨務署(打貓南堡打貓街) 嘉義辨務署(嘉義西堡嘉義城內)
店仔口辨務署(下茄苳南堡店仔口街) 鹽水港辨務署(鹽水港堡鹽水港街)
樸仔腳辨務署(大糠榔西堡樸仔腳街) 斗六辨務署(斗六堡斗六街)
西螺辨務署(西螺堡西螺街) 土庫辨務署(大坵田堡土庫街)
北港辨務署(大糠榔堡北港街) 林圮埔辨務署(沙連堡林圮埔街)
嘉義縣下共設14辨務署
台南縣
台南辨務署(台南城內) 關帝廟辨務署(外新豐里關帝廟街)
灣裡辨務署(善化里西堡灣裡街) 大穆降辨務署(大穆降庄大穆降街)
焦吧哖辨務署(焦吧哖庄焦吧哖街) 蕃薯寮辨務署(羅漢外門庄蕃薯寮街)
台南縣下共設6辨務署
鳳山縣
鳳山辨務署(大竹里鳳山城內) 打狗辨務署(興隆內里打狗)
阿公店辨務署(仁壽上里阿公店街) 大湖辨務署(長治二圖里大湖街)
內埔辨務署(港西下里內埔庄) 林邊辨務署(港東中里林邊街)
萬丹辨務署(港西下里萬丹街) 阿猴辨務署(阿猴街)
阿里港辨務署(阿里港街) 楓港辨務署(善餘里楓港庄)
恆春辨務署(宣化里恆春城內)
鳳山縣下共設11辨務署
宜蘭廳
頭圍辨務署(頭圍堡頭圍街) 宜蘭辨務署(本城堡宜蘭城內) 羅東辨務署(羅東堡羅東街)
利澤簡辨務署(利澤簡堡利澤簡街)
宜蘭廳下共設4辨務署
台東廳
卑南辨務署(卑南) 水尾辨務署(水尾) 奇萊辨務署(奇萊)
台東廳下共設3辨務署
澎湖廳
媽宮辨務署(澎湖本島媽宮城) 隘門辨務署(澎湖本島隘門) 小池角辨務署(漁翁島小池角)
大赤崁辨務署(白沙島大赤崁) 網垵辨務署(八罩島網垵)
澎湖廳下共設5辨務署
全台六縣三廳之下共設78辨務署，於1897年7月1日起至同年9月間陸續開設。
1897年10月7日以府令公布裁撤林邊辨務署，改設東港辨務署，署址位於港東中里東港街；
裁撤楓港辨務署，改設枋寮辨務署，署址位於港東下里枋寮街。
1897年10月14日以府令公布將北埔辨務署遷移至樹杞林並改名為樹杞林辨務署
此階段的辦務署掌理一般行政，縣廳之下另有警察署掌管警察行政，部分縣廳還設有
撫墾署掌管蕃地行政，施行以來產生官衙過多導致命令繁雜，冗員充斥的流弊；日本
殖民政府乃有裁併縣廳 辨務署的打算，並將警察署與撫墾署廢除，其職權併入辨務署，
辨務署長多由警察擔任，以加強警察統治；而台東廳內大多是蕃社，澎湖廳島嶼雖多
但人口較少，因而此兩廳的一般行政事務較單純，故將兩廳管內的辦務署廢除，改設
出張所。
1898年6月28日全島行政區劃改為三縣三廳，三縣與宜蘭廳之下的辨務署名稱及
位置如下(各辨務署之位置以括弧註明，而各辦務署之管轄區域本文暫略)：
台北縣
台北辨務署(大加蚋堡台北城內) 三角湧辨務署(海山堡三角湧街)
景尾辨務署(景尾街) 桃仔園辨務署(桃仔園街)
滬尾辨務署(芝蘭三堡滬尾街) 基隆辨務署(基隆堡基隆街)
水邊腳辨務署(水邊腳街) 頂雙溪辨務署(頂雙溪街)
新埔辨務署(新埔街) 新竹辨務署(竹北一堡新竹城內)
台北縣下共設10辨務署
台中縣
台中辨務署(藍興堡台中城內) 南投辨務署(南投堡南投街)
梧棲港辨務署(大肚中堡梧棲港街) 彰化辨務署(線東堡彰化城內)
鹿港辨務署(馬芝堡鹿港街) 北斗辨務署(東螺西堡北斗街)
員林辨務署(燕霧下堡員林街) 埔里社辨務署(埔里社堡埔里社城內)
斗六辨務署(斗六堡斗六街) 北港辨務署(大糠榔東頂堡北港街)
大甲辨務署(苗栗三堡大甲街) 苗栗辨務署(苗栗街)
台中縣下共設12辨務署
台南縣
台南辨務署(台南城內) 大穆降辨務署(大穆降庄大穆降街)
蕃薯寮辨務署(羅漢外門庄蕃薯寮街) 鳳山辨務署(大竹里鳳山城內)
阿公店辨務署(仁壽上里阿公店街) 阿猴辨務署(港西中里阿猴街)
潮州庄辨務署(港東上里潮州庄街) 東港辨務署(港東中里東港街)
恆春辨務署(宣化里恆春城內) 麻荳辨務署(麻荳堡麻荳街)
店仔口辨務署(下茄苳南堡店仔口街) 嘉義辨務署(嘉義西堡嘉義城內)
打貓辨務署(打貓南堡打貓街) 鹽水港辨務署(鹽水港堡鹽水港街)
樸仔腳辨務署(大糠榔西堡樸仔腳街)
台南縣下共設15辨務署
宜蘭廳
宜蘭辨務署(本城堡宜蘭城內) 羅東辨務署(羅東堡羅東街)
宜蘭廳下共設2辨務署
由上可知，1898年三縣三廳施行以後全台的辨務署減為39署。
1899年7月21日台北縣下各辦務署的名稱位置管轄區域更改如下(各辨務署之位置
以括弧註明，而各辦務署之管轄區域本文暫略)：
台北辨務署(大加蚋堡台北城內) 水返腳辨務署(石碇堡水返腳街)
基隆辨務署(基隆堡基隆街) 景尾辨務署(文山堡景尾街)
滬尾辨務署(芝蘭三堡滬尾街) 三角湧辨務署(海山堡三角湧街)
桃仔園辨務署(桃澗堡桃仔園街) 新竹辨務署(竹北一堡新竹城內)
1899年9月12日台中縣下各辦務署的名稱位置管轄區域更改如下(各辨務署之位置
以括弧註明，而各辦務署之管轄區域本文暫略)：
台中辨務署(藍興堡台中城內) 彰化辨務署(線東堡彰化城內)
北斗辨務署(東螺西堡北斗街) 南投辨務署(南投堡南投街)
斗六辨務署(斗六堡斗六街) 北港辨務署(大糠榔東頂堡北港街)
苗栗辨務署(苗栗街)
1900年3月25日台南縣下各辦務署的名稱位置管轄區域更改如下(各辨務署之位置
以括弧註明，而各辦務署之管轄區域本文暫略)：
台南辨務署(台南城內) 鳳山辨務署(大竹里鳳山城內)
東港辨務署(港東中里東港街) 阿猴辨務署(港西中里阿猴街)
蕃薯寮辨務署(羅漢外門里蕃薯寮街) 大目降辨務署(大目降里大目降街)
麻荳辨務署(麻荳堡麻荳街) 鹽水港辨務署(鹽水港堡鹽水港街)
嘉義辨務署(嘉義西堡嘉義城內) 恆春辨務署(宣化里恆春市街)
1900年9月18日台北縣水返腳辨務署裁撤，其轄區改歸基隆辨務署管轄。
1900年10月1日宜蘭廳下的宜蘭 羅東兩辨務署廢除，改設宜蘭 礁溪 頭圍 東港
羅東 叭哩沙 利澤簡與蘇澳等八個出張所。
1900年12月1日台北縣景尾辨務署廢除，改設深坑辨務署於深坑街。
1901年5月1日台南縣恆春辨務署廢除，原恆春辨務署管轄區域改設恆春廳，
並於同月25日在恆春廳下設置恆春 枋山與蚊蟀三個出張所。
所以到了1901年底廢縣置廳前夕，也就是辨務署廢除前夕，全台灣的辨務署數目
再減為23個。
本文僅列出涉及辨務署名稱或是數目變更的行政區劃改動，至於各辨務署管轄區域
的小幅變更以及1898年三縣三廳時期部分辨務署之下增設辨務支署的情形留待以後
有機會再說。
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