1898年6月28日全島行政區劃改為三縣三廳，即台北 台中 台南等三縣與
宜蘭 台東 澎湖等三廳，以下介紹各縣廳的下級行政區劃：
台北縣
台北辨務署
支署名：艋舺 大稻埕 大稻埕水上 錫口 士林
管轄範圍：
大加蚋堡 街庄數：158 區數：23
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區 第九區 第十區
第十一區 第十二區 第十三區 第十四區 第十五區
第十六區 第十七區 第十八區 第十九區 第廿區
第廿一區 第廿二區 第廿三區
芝蘭一堡 街庄數：45 區數：10
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區 第九區 第十區
芝蘭二堡 街庄數：43 區數：5
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
三角湧辨務署
支署名：大嵙崁 枋橋 枋寮 新庄
管轄範圍：
海山堡 街庄數：85 區數：17
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區 第九區 第十區
第十一區 第十二區 第十三區 第十四區 第十五區
第十六區 第十七區
興直堡 街庄數：63 區數：7
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區
擺接堡 街庄數：51 區數：12
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區 第九區 第十區
第十一區 第十二區
註：三角湧辨務署於1900年8月24日裁撤，改設大嵙崁辨務署
景尾辨務署
支署名：深坑 坪林尾
管轄範圍：
文山堡 街庄數：294 區數：22
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區 第九區 第十區
第十一區 第十二區 第十三區 第十四區 第十五區
第十六區 第十七區 第十八區 第十九區 第廿區
第廿一區 第廿二區
註：景尾辨務署於1900年12月1日裁撤，改設深坑辨務署
桃仔園辨務署
支署名：中壢
管轄範圍：
桃澗堡 街庄數：117 區數：29
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區 第九區 第十區
第十一區 第十二區 第十三區 第十四區 第十五區
第十六區 第十七區 第十八區 第十九區 第廿區
第廿一區 第廿二區 第廿三區 第廿四區 第廿五區
第廿六區 第廿七區 第廿八區 第廿九區
滬尾辨務署
支署名：土地公埔 滬尾水上 山腳庄 海墘厝
管轄範圍：
芝蘭三堡 街庄數：57 區數：12
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區 第九區 第十區
第十一區 第十二區
八里坌堡 街庄數：128 區數：11
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區 第九區 第十區
第十一區
基隆辨務署
支署名：瑞芳 基隆水上 金包里
管轄範圍：
基隆堡 街庄數：62 區數：11
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區 第九區 第十區
第十一區
金包里堡 街庄數：95 區數：12
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區 第九區 第十區
第十一區 第十二區
水邊腳辨務署
管轄範圍：
石碇堡 街庄數：108 區數：15
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區 第九區 第十區
第十一區 第十二區 第十三區 第十四區 第十五區
註：水邊腳辨務署於1900年9月16日裁撤，原管轄區域改隸基隆辨務署
頂雙溪辨務署
管轄範圍：
三貂堡 街庄數：37 區數：15
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區 第九區 第十區
第十一區 第十二區 第十三區 第十四區 第十五區
新埔辨務署
支署名：楊梅壢 大坵園
管轄範圍：
竹北二堡 街庄數：331 區數：25
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區 第九區 第十區
第十一區 第十二區 第十三區 第十四區 第十五區
第十六區 第十七區 第十八區 第十九區 第廿區
第廿一區 第廿二區 第廿三區 第廿四區 第廿五區
新竹辨務署
支署名：樹杞林 月眉 頭份 中港 南庄
管轄範圍：
竹北一堡 街庄數：451 區數：20
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區 第九區 第十區
第十一區 第十二區 第十三區 第十四區 第十五區
第十六區 第十七區 第十八區 第十九區 第廿區
竹南一堡 街庄數：179 區數：9
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區 第九區
台中縣
台中辨務署
支署名：葫蘆墩 犁頭店 社口
管轄範圍：
藍興堡 街庄數：33 區數：8
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區
貓羅堡 街庄數：66 區數：14
管區名：第九區 第十區 第十一區 第十二區 第十三區
第十四區 第十五區 第十六區 第十七區 第十八區
第十九區 第廿區 第廿一區 第廿二區
栜東上堡 街庄數：101 區數：13
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區 第九區 第十區
第十一區 第十二區 第十三區
栜東下堡 街庄數： 區數：14
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區 第九區 第十區
第十一區 第十二區 第十三區 第十四區
大肚下堡 街庄數：6 區數：1
管區名：第十五區
彰化辨務署
支署名：和美線
管轄範圍：
線東堡 街庄數：66 區數：9
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區 第九區
線西堡 街庄數：69 區數：7
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區
鹿港辨務署
管轄範圍：
馬芝堡 街庄數：154 區數：
二林上堡 街庄數：28 區數：
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區 第九區 第十區
第十一區 第十二區 第十三區 第十四區 第十五區
第十六區 第十七區 第十八區 第十九區 第廿區
第廿一區 第廿二區 第廿三區
梧棲港辨務署
支署名：大肚 牛馬頭
管轄範圍：
大肚上堡 街庄數：57 區數：10
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區 第九區 第十區
大肚中堡 街庄數：50 區數：8
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區
大肚下堡 街庄數：35 區數：6
管區名：第九區 第十區 第十一區 第十二區 第十三區
第十四區
註：大肚下堡內共41街庄，其中烏日庄等6庄隸台中辨務署
大甲辨務署
支署名：通霄 苑裡
管轄範圍：
苗栗二堡 街庄數：51 區數：9
管區名：苑裡街 通霄街 房裡街 白沙墩庄 內湖庄
五里牌庄 貓孟庄 田寮庄 山腳庄
苗栗三堡 街庄數：98 區數：13
管區名：大甲街 內埔庄 外埔庄 內溪底庄 外溪底庄
七庄 上九庄 下九庄 東八庄 西八庄
南三庄 北三庄 五庄
苗栗辨務署
支署名：後壟 大湖
管轄範圍：
苗栗一堡 街庄數：99 區數：14
管區名：苗栗街 後壟街 銅鑼灣街 大湖街 崁頭屋庄
二湖庄 三叉河庄 雞隆庄 新開庄 五鶴山庄
公館庄 芎中七庄 獅潭庄 四湖庄
南投辨務署
支署名：草鞋墩
管轄範圍：
南投堡 街庄數：99 區數：8
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區
北投堡 街庄數：53 區數：6
管區名：第九區 第十區 第十一區 第十二區 第十三區
第十四區
沙連下堡 街庄數：11 區數：1
管區名：第十六區
集集堡 街庄數：23 區數：12
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區 第九區 第十區
第十一區 第十二區
埔里社辨務署
管轄範圍：
埔里社堡 街庄數：57 區數：9
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區 第九區
五城堡 街庄數：38 區數：4
管區名：第十區 第十一區 第十二區 第十三區
北港溪堡 街庄數：5 區數：1
管區名：第十四區
北斗辨務署
支署名：沙仔崙 二林 番挖
管轄範圍：
東螺東堡 街庄數：54 區數：6
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區
東螺西堡 街庄數：43 區數：9
管區名：第七區 第八區 第九區 第十區 第十一區
第十二區 第十三區 第十四區 第十五區
二林下堡 街庄數：39 區數：6
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區
深耕堡 街庄數：75 區數：11
管區名：第七區 第八區 第九區 第十區 第十一區
第十二區 第十三區 第十四區 第十五區 第十六區
第十七區
員林辨務署
支署名：永靖 社頭
管轄範圍：
燕霧下堡 街庄數：27 區數：5
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
燕霧上堡 街庄數：25 區數：4
管區名：第六區 第七區 第八區 第九區
武東堡 街庄數：75 區數：10
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區 第九區 第十區
武西堡 街庄數：50 區數：9
管區名：第十一區 第十二區 第十三區 第十四區 第十五區
第十六區 第十七區 第十八區 第十九區
北港辨務署
支署名：土庫 麥寮 牛挑灣
管轄範圍：
大糠榔堡 街庄數：1街27庄 區數：5
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
蔦松堡 街庄數：15 區數：1
管區名：第六區
尖山堡 街庄數：64 區數：6
管區名：第七區 第八區 第九區 第十區 第十一區
第十二區
白沙墩堡 街庄數：32 區數：3
管區名：第十三區 第十四區 第十五區
大坵田堡 街庄數：1街59庄 區數：4
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區
布嶼堡 街庄數：2街110庄 區數：5
管區名：第五區 第六區 第七區 第八區 第九區
打貓北堡 街庄數：1街20庄 區數：2
管區名：第十區 第十一區
西螺堡 街庄數：2街56庄 區數：5
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
海豐堡 街庄數：1街73庄 區數：6
管區名：第六區 第七區 第八區 第九區 第十區
第十一區
註：以上北港辨務署所轄之蔦松堡及打貓北堡為舊雲林支廳管轄的部分
斗六辨務署
支署名：他里霧 樹仔腳
管轄範圍：
斗六堡 街庄數：1街75庄 區數：5
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
溪州堡 街庄數：47 區數：2
管區名：第六區 第七區
他里霧堡 街庄數：1街70庄 區數：6
管區名：第八區 第九區 第十區 第十一區 第十二區
第十三區
沙連堡 街庄數：2街42庄 區數：8
管區名：第一區 第二區 第三區 第四區 第五區
第六區 第七區 第八區
鯉魚頭堡 街庄數：11 區數：3
管區名：第九區 第十區 第十一區
打貓東頂堡 街庄數：38 區數：１
管區名稱不詳
註：以上斗六辨務署所轄之打貓東頂堡為舊雲林支廳管轄的部分
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