孢子囊是蕨類植物蘊藏孢子之處，個頭很小，有些種類甚至須使用放大
鏡或顯微鏡才能一窺其貌。其形狀依種類而異，有卵形或橢圓形（如水
龍骨科）、球形（如紫萁科、水蕨科）、長卵形或長橢圓形（如海今沙
科）…等。

依孢子囊壁細胞的多寡，真蕨類植物可分為「厚囊蕨」與「薄囊蕨」兩
類。厚囊蕨類的孢子囊壁細胞多層，囊內孢子數量極多，如瓶爾小草與
觀音座蓮舅兩科；薄囊蕨類的孢子囊壁細胞只有一層，囊內細胞數量通
常為64個，大多數的真蕨類都屬於薄囊蕨。

典型的孢子囊大都是一個卵形本體與孢子囊柄組成，在本體上有一列稱
為「環帶」的厚膜細胞，孢子囊開裂時孢子可藉環帶反捲的彈力飛散。
一個孢子囊內所含有的孢子數目依種類不同而不一，最少為16個，普通
為32至64個，有些較原始的蕨類甚至可多達1000個以上（如觀音座蓮舅
科）。

孢子囊大都由數個至多數集合成孢子囊群，孢子囊群或著生於葉緣、或
著生於葉脈、或於葉表面全面著生，依種類不同而著生方式互異。為了
保護孢子囊群，蕨類植物們各顯神通，花招層出不窮。有的蕨類著生孢
子囊群的部位凹入而具有保護作用，如車前蕨、海岸星蕨等；有的孢子
囊群內混生有長毛或絲狀體，如瓦葦、石葦、粉葉蕨等；有的葉片或葉
緣凹陷，來包被或藏納孢子囊群，如書帶蕨等；有些種類的葉緣膜質化
，形成「假孢膜」，用以包被孢子囊群，如鐵線蕨屬、鳳尾蕨屬；有些
種類則有「孢膜」（由孢子囊托或其附近的表皮細胞所生成）可保護孢
子囊群，孢膜形狀有圓形、口袋形、腎形、線形…等，而孢膜的形狀、
大小、著生方式與開裂方式與蕨類的分類有關。　　

石松科、卷柏科等擬蕨類植物的孢子囊通常藏在孢子葉基部，孢子葉再
集生於之條末端，形成「孢子囊穗」。孢子囊穗有無柄狀構造，攸關它
們的分類。

蘋科、槐葉蘋科、滿江紅科等水生蕨類於葉片基部長出「孢子囊果」，
以蘊藏孢子；至於水韭的孢子囊則長在葉子基部內側。

蕨類孢子囊群的模樣與著生方式組合起來複雜多變，花樣百出，往往可以
令觀察者著迷，而且因為孢子囊群形狀互異，較好分辨，是做蕨類分類時
最方便最容易著手之處，若能有15～20倍左右的放大鏡輔助，觀察起來會
更得心應手。