※ 引述《chenhc (青島)》之銘言：
: 其中一門“資訊工程導論”
: 有沒有人修過，說一下感覺...
: 我是化工的，修這門會不會很吃力呢？
: 3Q
這門課第一次開
高成炎老師的課
老師人很好
課應該不錯(老師自己說的)
是開給非資訊背景的生物資訊學生的
(老師說等同於資工系大二的程度、助教偷偷說是通識水準，不知道真的假的)
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作者: vyvyan (忙碌 是為了將來) 看板: NTUcourse
標題: [情報] 生物資訊與計算分子生物學的報告寫法
時間: Tue Sep 23 14:50:56 2003
1.進入NCBI的網頁 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
在Search欄點選 "Nucleotide" 並在右方key 入你選取的gene名稱
老師的範例是"stk6"
輸入後按確定
選一個"人類"的基因有關選項
若有兩個以上就選擇最完整的那個
老師的範例是選擇第二項
點選進去後
將 LOCUS DEFINITION DNA序列 Protein序列複製下來
2.同樣在NCBI的網站
在Search欄點選 "UniGene" 並在右方key 入你選取的gene名稱
同樣也是找尋和人類基因有關的選項
老師的範例是選2
將出來的畫面print下來
作為第二張投影片
標題為"SELECTED MODEL ORGANISM PROTEIN SIMILARITIES"
3.同樣在NCBI的網站
在Search欄點選 "OMIM" 並在右方key 入你選取的gene名稱
Print出來的畫面
4.接上例3.
點取出現網頁上方有關基因在染色體上的位置連結
找到你的目標基因 點選進去
Print 這個畫面
5.進入GeneCard的網站
http://bioinformatics.weizmann.ac.il/cards/
輸入你的基因名稱
畫面出來後 點選你的目標基因說明左方的 "Display the complete GeneCard"
Print出來的畫面
6.接5.的例題
應可以上同一畫面裡找到"gene ontology"的連結
點進去
看到"What is gene ontology?"的連結
老師說要點進去看一看
7.同樣接5.的例題
在同一畫面找到"Swiss-Prot"的連結
點選右上方 "Prosite"的連結
進去後 在下方一點的空格填入你的基因名稱(藍色背景的部分)
Print出來的畫面
(這一個我覺得怪怪的...大家先自己看看...)
8.進入KEGG的網站
http://www.genome.ad.jp/kegg/kegg2.html
輸入你的pathway
並print下來那個pathway的圖
9.進入Biocarta的網頁
http://cgap.nci.nih.gov/Pathways/Pathway_Searcher
輸入你的pathway
print下來那個pathway的圖
10. 進入SMD的網站
http://genome-www5.stanford.edu//
點選左方S.O.U.R.C.E的連結
輸入你的目標基因
Print畫面
11.接上例10.
在同一個畫面內找到"Show Gene Expression Data"
點進去
選NCI60的連結進去
把出來的畫面下面那一條黑黑的蛋白質序列點開
會有一大片圖出來
把整頁print下來
這次的報告要做這11面的powerpoint...
下下禮拜二上課之前交....
ps..凡受用這篇文章的同胞們
要在心中大喊"Miss Lu 同學~~~謝謝你~~~" ^^"
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打的很辛苦ㄋㄟ....^^"
大家要記得寫報告唷~~~
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