老師在上課時就只有說這麼一句話....
而在上一屆的共筆中找不到....
且課本講的好像也是另一件事....
本來以為不重要就照老師講的打了....
至於我打的時候的想法是...
在轉錄一段VDJ基因時會遇到像前一頁(p.4)所說的順向或反向的問題....
而用來決定是順向或反向的(共筆上說的上下游)...
就是這兩個spacers(12or23)的位置....
若是23bp在前12bp在後則是順向，12bp在前則是反向需要進行inversion
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作者: Juipeter (我要當貓頭鷹^_^) 看板: NTUmed89work
標題: Re: [訂正] 免疫No.10
時間: Mon May 5 00:38:05 2003
※ 引述《shoulai ( )》之銘言：
: ※ 引述《danui (JAK & STATs)》之銘言：
: 至於我打的時候的想法是...
: 在轉錄一段VDJ基因時會遇到像前一頁(p.4)所說的順向或反向的問題....
: 而用來決定是順向或反向的(共筆上說的上下游)...
: 就是這兩個spacers(12or23)的位置....
好像不是耶，課本說決定的是transcriptional orientation
以下是管理組不負責任看法:
若是 same transcriptional orientation的話，就經過looping out(deletion)
圖解~
-> -> ->->
█----█ => ██
V J V J
若是 opposite transcriptional orientation的話，就經過inversion
圖解~
<- -> Vn J
█----█ => ██ (請同學自行對照共筆或課本旋轉)
Vn J ->->
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作者: Leiwone (等待重生) 看板: NTUmed89work
標題: Re: [訂正] 免疫No.10
時間: Tue May 6 11:36:24 2003
※ 引述《Juipeter (我要當貓頭鷹^_^)》之銘言：
: 標題: Re: [訂正] 免疫No.10
: 時間: Mon May 5 00:38:05 2003
:
: ※ 引述《shoulai ( )》之銘言：
: : ※ 引述《danui (JAK & STATs)》之銘言：
: : 至於我打的時候的想法是...
: : 在轉錄一段VDJ基因時會遇到像前一頁(p.4)所說的順向或反向的問題....
: : 而用來決定是順向或反向的(共筆上說的上下游)...
: : 就是這兩個spacers(12or23)的位置....
: 好像不是耶，課本說決定的是transcriptional orientation
: 以下是管理組不負責任看法:
: 若是 same transcriptional orientation的話，就經過looping out(deletion)
: 圖解~
: -> -> ->->
: █----█ => ██
: V J V J
: 若是 opposite transcriptional orientation的話，就經過inversion
: 圖解~
: <- -> Vn J
: █----█ => ██ (請同學自行對照共筆或課本旋轉)
: Vn J ->->
:
: --
: ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.csie.ntu.edu.tw)
: ◆ From: 140.112.212.222
: ※ 編輯: Juipeter 來自: 140.112.212.222 (05/05 00:45)
: → blueteeth:太強了!!請問你是地球人嗎?? 推140.112.212.224 05/05
: → Leiwone:我跟俊毅覺得柏志的說法怪怪的~~ 推 140.112.213.86 05/05
: → Juipeter:可以說說你們的看法嗎? 推140.112.212.222 05/05
我們是覺得問題出在"orientation"這個字上
same transcriptional orientation
好像是: => <=
opposite transcriptional orientation
則是: <= <=
不一定正確啦
只是覺得好像是這樣
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作者: wasong (講不出話來) 看板: NTUmed89work
標題: Re: [訂正] 免疫No.10
時間: Tue May 6 12:05:18 2003
※ 引述《henang (為醫護人員打氣)》之銘言：
: ※ 引述《Juipeter (我要當貓頭鷹^_^)》之銘言：
: : 好像不是耶，課本說決定的是transcriptional orientation
: : 以下是管理組不負責任看法:
: : 若是 same transcriptional orientation的話，就經過looping out(deletion)
: : 圖解~
: : -> -> ->->
: : █----█ => ██
: : V J V J
: : 若是 opposite transcriptional orientation的話，就經過inversion
: : 圖解~
: : <- -> Vn J
: : █----█ => ██ (請同學自行對照共筆或課本旋轉)
: : Vn J ->->
: 柏志大大.....
: 我不懂的是 orientation的方向怎麼決定
: 如果是用heptamer和nonamer來看
: 也就是說由heptamer指向nonamer是他的方向的話.....
: 那柏志你劃的J的方向
: 就跟fig4.6剛好相反....
我覺得他所說的orientation應該是指J和V這兩段sequence的序列是否同向
如果同向才可由promotor做一系列的transcription...
就像柏志的上圖...
如果反向...則必須經過Fig.4.6右邊的inversion，右下圖黃色J的左邊，
黏到上面紅色V的左邊...降子是不是剛好就變成同向了呢~~^^
同向之後同樣的及可由promotor做一系列的transcription
所以我覺得他的orientation並不是指heptamer和nonamer的方向...