第1集：出發！雙葉鎮到真砂鎮！
第2集：尋找皮卡丘！202號道路！
第3集：勁敵對戰！三對三！
第4集：波加曼對含羞苞！小光的初次對戰！
第5集：收服草苗龜吧！
第6集：迷幻之森！再次遇見真司！
第7集：波加曼加油！
第8集：神祕道館裡的不良蛙！
第9集：和捲捲耳一起玩！？
第10集：神奇寶貝錶難以入手！？
第11集：小光！首次的華麗大賽！！
第12集：華麗對戰賽！勁敵對決！！
第13集：姆克兒加油！
第14集：就交給小剛吧！
第15集：鋼鐵道館！瓢太對抗真司！！
第16集：頭蓋龍對抗皮卡丘！
第17集：古代神奇寶貝大進擊！
第18集：再戰鋼鐵道館！決戰戰槌龍！！
第19集：收服到帕奇利茲…就沒問題了！？
第20集：神奇寶貝獵人J！
第21集：最強的鯉魚王和最美麗的笨笨魚！
第22集：帕奇利茲對抗長尾怪手！華麗對戰賽！！
第23集：大鋼蛇失控！守護大牙狸的村落！！
第24集：對決！小智對皮卡丘！？
第25集：怪傑羅絲雷朵與花之傳說！
第26集：神奇寶貝華麗大賽！苑之大會！！
第27集：決戰！波加曼對抗波皇子
第28集：飄飄球與北風的使者
第29集：小智與小光！打雙打對戰沒問題！？
第30集：百代森林！結草兒進化作戰！
第31集：草苗龜對草苗龜！速度對決！
第32集：琥珀之城的蜂后！
第33集：我喜歡！神奇寶貝扮演大會！
第34集：泳氣鼬！邁向最強之路！
第35集：四天王悟松與青銅鐘！
第36集：神奧時空傳說！
第37集：百代道館！對抗菜種！！
第38集：爆誕！單車路！！
第39集：皮卡丘留守記！
第40集：冠軍‧竹蘭登場！
第41集：小光與小望與雙人演出！
第42集：落雷獸訓練中心！
第43集：夢妖魔！從惡夢中逃脫！！
第44集：幫助迷路的怪河馬！
第45集：獵人J再度現身！保護盾甲龍！！
第46集：迷宮內大洗牌！全員齊心協力！！
第47集：小麥與凱西與水底！
總集篇：小智與小光！朝新的冒險邁進!!（台灣不播）
第48集：神奇寶貝華麗大賽！緣之大會！！
第49集：全員參加！雙打對戰！！
第50集：小火焰猴對抗貓鼬斬！命運的對決！！
第51集：雙打對戰！最終對決！！
第52集：小火焰猴的眼淚！
第53集：菜種與沙漠奈亞！告別是為了誰！
第54集：長尾怪手與泳氣鼬！各自的道路！！
第55集：花岩怪的楔石！
第56集：大尾狸早就知道了！
第57集：大朝北鼻！熾熱的靈魂！
第58集：倫琴貓之瞳！
第59集：隨意遺跡的未知圖騰
第60集：神奇寶貝華麗大賽！隨意大會！
第61集：女僕咖啡廳的大奶罐！
第62集：小山豬三重奏與溫泉霧氣對戰！！
第63集：天蠍王與天蠍！衝出風之迷宮！
第64集：帕奇利茲在河馬獸的口中！？
第65集：路卡利歐！憤怒的波導彈！
第66集：小光的第一場道館賽！！
第67集：帷幕道館！路卡利歐對泳氣鼬！！
第68集：新潮打扮！其名為銀河隊！！
第69集：振作起來 鈴噹響！
第70集：神奇寶貝保育家！波導的利歐路！！（前篇）
第71集：神奇寶貝保育家！波導的利歐路！！（後篇）
第72集：再見了 毒粉蝶！
第73集：皮卡丘！雷丘！通往進化之道！！
第74集：華麗大賽大師 米可利登場！
第75集：七星級七星飯店！靠雙打對戰吃到全餐！！
第76集：大家都是勁敵！米可利杯！
第77集：激戰！各自的對戰！
第78集：決戰！小光對小遙！
第79集：陽陽瑪收服大作戰！
第80集：灼熱的小火焰猴！
第81集：濕原大濕地的不良蛙祭典！？
第82集：濕原道館！VS極限假面！！
第83集：羨慕先生家的大胃王小山豬！
第84集：天蠍！友情之翼！！
第85集：緣之時裝大會！通往神奇寶貝風格設計師之路!!
第86集：路霸可達鴨！
第87集：神奇寶貝暑期講座開課！！
第88集：研究報告「湖的傳說」！！
第89集：放學後是幽靈出沒時刻！？
第90集：最後的大決戰！神奇寶貝鐵人三項！！
第91集：回歸原點的火箭隊！？
第92集：舞動的道館訓練家！梅麗莎登場！！
第93集：帕奇利茲發燒了！兩個人看家！？
第94集：神奇寶貝華麗大賽！神和大會！！
第95集：銀河隊來襲！！－前篇－
第96集：銀河隊來襲！！－後篇－
第97集：飄浮的不明怪物！？
第98集：四天王阿柳！相遇與別離之森！
第99集：草苗龜、樹林龜…以及土台龜！
第100集：勁敵訓練家‧阿馴登場！！
第101集：緣之道館賽！VS梅麗莎！！
第102集：混戰混亂的水脈市！！
第103集：克雷色利亞對達克萊伊
第104集：羊羹與洛托姆！
第105集：和神奇寶貝感情融洽的方法！？
第106集：戰槌龍VS護城龍！！
第107集：水脈道館賽！鋼系對戰！！
第108集：迷路的吼吼鯨！
第109集：亞玄與路卡利歐！
第110集：鋼鐵島的遺跡！
第111集：皮卡丘波加曼漂流記！
第112集：愛惡作劇的霏歐納！
第113集：神奇寶貝華麗大賽！木通大會！！
第114集：狂野君莎與搭檔聒噪鳥！
第115集：暴風雪中的雪妖女！
第116集：火箭隊解散！？
第117集：神奇圓環！天空大決戰！！
第118集：激烈衝突！象牙豬對波士可多拉！！
總集篇：不可思議的生物 神奇寶貝！（台灣不播）
第119集：怕寂寞的雪笠怪！
第120集：進化！這時候波加曼會如何！？
第121集：神奇寶貝華麗大賽‧立浪大會！
第122集：神奇寶貝乒乓大會！雙尾怪手加油！！
第123集：櫻花寶！讓人心疼的對戰！？
第124集：訓練家培育學園的小菘老師！
第125集：切鋒道館！冰之對戰！
第126集：對戰金字塔！真司對神代！！
第127集：復活的雷吉奇卡斯！J再度出現！！
第128集：電龍列車！帥哥登場！！
第129集：全面對戰！真司對小智！！（前篇）
第130集：全面對戰！真司對小智！！（後篇）
第131集：由克希之影！
第132集：森林之王！巨蔓藤！！
第133集：全員參戰！神奇寶貝大勝利！！
第134集：天冠山的遺蹟！銀河隊的陰謀！！
第135集：瑪力露‧波加曼‧電擊怪！！
第136集：小光VS媽媽！親子對決！！
第137集：拯救大木博士！牛蛙君對不良蛙！！
第138集：天然雀、天然鳥…不可思議的森林！
第139集：對戰大君！那名男子名叫桄榔！！
第140集：史上最邪惡的波克比！
第141集：城都特展！菊草葉與小鋸鱷登場！！
第142集：攻破地窖！？山谷間的發電廠！
第143集：收服到…圓陸鯊了！！
第144集：ポケモンコンテスト！スイレン大会!!
第145集：サトシとヒカリ！タッグバトル!!
第146集：ムウマとヤミカラスとやみのいし！
第147集：ピカチュウポッチャマくっつかないで!!
第148集：赤い鎖！ギンガ団始動!!
第149集：アグノム・ユクシー・エムリット！
第150集：ディアルガとパルキア！最後の戦い!!
第151集：危険がいっぱい！コジロウの宝箱!!
第152集：エアバトルマスター登場！グライオンVSハッサム!!
第153集：ダブルバトル！マンムーとヒノアラシ!!
第154集：フカマルとりゅうせいぐん!!
第155集：フカマル！ゲットだぜ!!
第156集：爆走！ジバコイルVSメタグロス!!
第157集：唸れれいとうパンチ！ブイゼルVSバリヤード!!
第158集：燃えよカビゴン！ポケスロンの王者!!
第159集：ポケモンコンテスト・アサツキ大会!!
第160集：ダブルバトル！ VSプラスル・マイナン!!
第161集：爆進化!ゴウカザル!!
第162集：ポッチャマはぐれる!
第163集：四天王オーバとジムリーダー・デンジ!
第164集：発進!ナギサタワー!!
第165集：海辺のポケモンスクール!
第166集：飛べシェイミ!空の彼方へ!!
第167集：ポケモンレンジャー!ヒードラン救出作戦!!
第168集：四天王キクノ!カバルドンVSドダイトス!!
第169集：トゲキッス舞う!王女さまのポケモンコンテスト!!
第170集：トゲキッス!華麗なるバトル!!
第171集：メタモン・へんしんバトル!本物はドッチ～ニョ!?
第172集：グランドフェスティバル開幕！炎と水のアート!!
第173集：マンムー、パチリス!決めろ氷のシャンデリア!!
第174集：セミファイナル!決勝へ進むのは!?
第175集：決着ライバル対決!ヒカリVSノゾミ!!
第176集：さよならロケット団!ニャースの恋!?
第177集：電撃バトル!最後のバッジ!!
第178集：サトシＶＳケンゴ!それぞれの船出!
第179集：トレジャーハンター・バクとヤジロン!
第180集：熱戦前夜！サトシのポケモン大集合！！
第181集：開幕！シンオウリーグ・スズラン大会！！
第182集：シンオウリーグ三回戦！シンジ対ジュン！！
第183集：恐怖のトリックルーム！サトシ対コウヘイ！！
第184集：ライバル決戦！サトシ対シンジ！！
第185集：激闘フルバトル！サトシ対シンジ！！
第186集：決着ライバルバトル！サトシ対シンジ！！
第187集：シンオウリーグ準決勝！ダークライ登場！！
第188集：ポケモンドクター・タケシ！
第189集：思い出はパール！友情はダイヤモンド！！