第1話：神奇寶貝，就決定是你了！
第2話：神奇寶貝中心大對決！
第3話：收服神奇寶貝！
第4話：武士少年的挑戰！
第5話：尼比市的決鬥！
第6話：皮皮與月亮石！
第7話：華藍市的水中花
第8話：邁向神奇寶貝的擂台之路
第9話：神奇寶貝必勝指南
第10話：神奇寶貝鄉的妙蛙種子
第11話：走失的小火龍
第12話：傑尼龜軍團
第13話：正輝的燈塔
第14話：對擊電戰枯葉道館
第15話：聖安奴號之戰
第16話：神奇寶貝漂流記！
第17話：巨大神奇寶貝之島
第18話：藍普魯奇的渡假日
第19話：神奇寶貝大進擊
第20話：幽靈神奇寶貝和夏天廟會
第21話：巴大蝴再見
第22話：凱西，超能力大決鬥
第23話：在神奇寶貝塔收服幽靈
第24話：鬼斯通對抗超能力
第25話：火爆猴，別生氣喔!
第26話：艾莉嘉和臭臭花
第27話：素利拍與神奇寶貝催眠
第28話：美容街！飼養家大決鬥
第29話：格鬥神奇寶貝大決鬥
第30話：小磁怪的電氣老鼠之夢
第31話：好多地鼠
第32話：淺紅道館的忍者決鬥
第33話：火焰神奇寶貝大賽跑
第34話：袋龍的搖籃曲
第35話：迷你龍的傳說
第36話：暴風雨的單車路
第37話：百變怪跟模仿少女
第38話：皮卡丘的森林
第39話：伊布四兄弟
第40話：醒來吧！卡比獸
第41話：神奇寶貝道館的決鬥
第42話：椰蛋樹軍團大前進
第43話：派拉斯和派拉斯特
第44話：胖丁會唱歌
第45話：復活？化石神奇寶貝
第46話：吉利蛋的病歷簿
第47話：卡蒂狗和小次郎
第48話：大蔥鴨的蔥
第49話：波克比是誰的呢?
第50話：妙娃種子的不思議花園
第51話：激鬥!!神奇寶貝娃娃節
第52話：兒童節全員大集合
第53話：警犬卡蒂狗
第54話：按快門的機會是皮卡丘
第55話：神奇寶貝檢定考
第56話：撫養家的秘密
第57話：燃燒吧!!紅蓮道館
第58話：決戰紅蓮道館
第59話：水箭龜之島
第60話：華籃道館!!水中的戰鬥
第61話：皮皮對抗胖丁
第62話：常磐道館，最後的徽章
第63話：神奇寶貝馬戲團的吸盤魔偶
第64話：迷唇姐的聖誕節
第65話：用大岩蛇露營
第66話：宿敵大決鬥，大木研究所
第67話：當呆呆獸變成呆河馬的時候
第68話：踏浪皮卡丘的傳說
第69話：植物園的臭臭花
第70話：神奇寶貝電影
第71話：喵喵之歌
第72話：四大天王希巴登場
第73話：激烈衝突超古代神奇寶貝
第74話：嘎啦嘎啦的骨頭棒
第75話：開火，神奇寶貝聯盟的火焰
第76話：神奇寶貝聯盟開幕，水之場地!
第77話：冰之場地，火焰之戰！
第78話：草之場地意外的強敵
第79話：勁敵登場
第80話：石英運動場VS阿弘
第81話：神奇寶貝聯盟最後的戰鬥
第82話：真新鎮，新的開始
第83話：飛行船是不幸船?
第84話：南國神奇寶貝與GS球
第85話：拯救乘龍
第86話：橘子聯盟夏干道館
第87話：消失的神奇寶貝之謎
第88話：水晶大岩蛇
第89話：粉紅神奇寶貝之島
第90話：化石盔的化石秘密
第91話：跳吧！神奇寶貝豪華友輪
第92話：再見可達鴨，又來了哥達鴨！
第93話：航海的喬依，破浪前進吧
第94話：奈普魯道館 雪山之戰
第95話：大胃王卡比獸！大恐慌！
第96話：幽靈船跟幽靈神奇寶貝
第97話：喵喵之島
第98話：飛天螳螂，戰士的尊嚴
第99話：南方之島，全員大集合
第100話：四天王科拿，冰之戰鬥
第101話：尼多朗的戀愛故事
第102話：大平原的小磁怪
第103話：下水道的怪物
第104話：柚子道館類型格鬥三比三
第105話：皮卡丘對抗喵喵
第106話：噴火龍，就決定是你了！
第107話：滅火大賽，傑尼龜對抗卡咪龜
第108話：燃燒吧！卡比獸！
第109話：接棒決戰，最後的道館！
第110話：鯉魚王的進化秘密！
第111話：蚊香蝌蚪和小霞！
第112話：勝利者盃，全員大對決，六VS六
第113話：最終戰鬥，快龍登場！
第114話：再見了，乘龍！
第115話：頑皮彈大爆炸
第116話：真新鎮，我回來了
第117話：宿敵大對決，小茂對抗小智
第118話：若葉鎮，吹起開啟之風的城鎮
第119話：投手的菊草葉
第120話：赫拉剋羅斯對抗大甲
第121話：頓甲之谷
第122話：咕咕跟迷惑森林
第123話：美麗花的戰鬥之舞
第124話：線球大搜索線
第125話：布盧的華麗生活
第126話：驚角鹿，幻影森林
第127話：好勝的菊草葉
第128話：沼王和GS球
第129話：芭瓢蟲之笛
第130話：幸福蛋的快樂護士
第131話：喇叭芽之塔，大危機
第132話：桔梗道館，空中大戰
第133話：愛哭鬼，瑪力露
第134話：暴走，尾立和波克比
第135話：噴火龍山谷，直到下次重逢
第136話：向日花怪會場大恐慌
第137話：菊草葉不高興了
第138話：毽子草飛跑了，大草原之戰
第139話：天蠍和天蠍人登場
第140話：咩利羊和牧場的少女
第141話：巨鉗螳螂對抗赫拉剋羅斯
第142話：收服火球鼠
第143話：檜皮鎮的呆呆獸之井
第144話：榛果球與圓柑果實，後山之戰
第145話：檜皮道館！森林的戰鬥場地！
第146話：桐樹林，尋找大蔥鴨
第147話：果然翁與神奇寶貝交換大會
第148話：傑尼龜軍團！一起燃燒吧！
第149話：好多烏波！
第150話：布盧和胖丁！
第151話：黑暗神奇寶貝，戴魯比！
第152話：小鋸鱷是誰的？小智對抗小霞
第153話：盔甲鳥對抗火球鼠，鋼鐵之翼
第154話：小鋸鱷！跳出愛的舞步！
第155話：抓到漂亮的貓頭夜鷹
第156話：圈圈熊，嚇死人
第157話：麒麟奇，超能力神奇寶貝之村
第158話：占卜，大混亂
第159話：滿金道館，力量與速度
第160話：大奶罐，復仇之戰
第161話：收訊塔的戰鬥，超越時空
第162話：捕蟲大會，在自然公園收服他！
第163話：胡說樹在哪裡？
第164話：古代神奇寶貝公園，阿露福遺跡
第165話：波波屋的傳信波波
第166話：超音蝠之館，危險的迷宮
第167話：柯波朗對抗妙蛙種子，格鬥大對決
第168話：叢林的三隻，溫泉戰鬥
第169話：金魚王釣魚戰鬥
第170話：再見了六尾，神奇寶貝選美比賽
第171話：壺壺對抗喇叭芽
第172話：月精靈！暗夜的戰鬥！
第173話：安瓢蟲！飛越風之谷吧！
第174話：果然翁之村
第175話：百變怪大師，與伊美蒂重逢
第176話：喵喵跟布盧跟布盧皇
第177話：阿利多斯，忍術戰鬥
第178話：展翅吧，陽陽瑪，飛向明天的天空
第179話：皮卡丘與皮丘
第180話：毽子花，草神奇寶貝戰鬥
第181話：黑魯加與波克比
第182話：燃燒塔，小松登場
第183話：圓朱道館鬼斯戰鬥
第184話：伊布五姐妹，在茶會作戰
第185話：黑暗鴉！被奪走的徽章！
第186話：鐵炮魚的天空
第187話：熊寶寶的秘密
第188話：冰凍向日種子之謎！
第189話：挖這裡吧!!小山豬，找出溫泉
第190話：急凍鳥對抗胖丁！在那風雪中
第191話：風速狗與火焰之石！
第192話：土龍弟弟全都沒了？！
第193話：果然翁遇難了！？
第194話：小剛暈倒？？危險的露營事件！！
第195話：大力鱷VS水箭龜！！相撲大賽！
第196話：與神奇寶貝說話,神奇寶貝的語言,神奇寶貝的心情
第197話：大嘴蝠對抗假面具女王武藏，遺跡之戰
第198話：圖圖犬的奇蹟！在朝陽中閃爍！
第199話：尼多力諾和尼多娜，小剛的玫瑰色生活
第200話：再見了，菊草葉 電氣的迷宮
第201話：月桂葉到哪裡去了？在藥草園抓住牠！
第202話：天然雀占卜！預測未來的神秘！
第203話：神奇寶貝氣球大賽，超越暴風雨
第204話：迷唇娃迷死人，超級巨星喜歡神奇寶貝
第205話：踏浪追蹤鐵甲暴龍！湖之戰！
第206話：變隱龍在哪裡？看不見的神奇寶貝，大混亂！
第207話：討厭水系神奇寶貝的喬伊！小霞的憤怒！
第208話：聖母大奶罐，沙漠的秘密
第209話：光輝燈塔!淺蔥市的戰鬥
第210話：湛藍道館，正面決鬥，格鬥大對決
第211話：漩渦列島，新的挑戰！
第212話：波波與大波波，飛向未曾見過的天空！
第213話：向大海出發吧，燈籠魚大遊行
第214話：太陽珊瑚好朋友！黃岩島的對決
第215話：巨翅飛魚跟沉船，神秘神奇寶貝的秘密
第216話：章魚桶跟鐵炮魚！漩渦列島大賽預賽！
第217話：漩渦列島大賽，在水的運動場大戰鬥！
第218話：小智對抗小霞，漩渦列島大賽最後的戰鬥！
第219話：保護地鼠的村子，陷阱大作戰
第220話：銀色之翼的傳說，銀岩島的戰鬥！
第221話：神秘的神奇寶貝！Ｘ！
第222話：被抓走的洛奇亞！
第223話：與洛奇亞的約定
第224話：飛吧咕咕號！以淺蔥市為目標！
第225話：淺蔥市VS大鋼蛇
第226話：再見妙蛙種子！大木家後院大冒險！
第227話：太陽精靈與櫻花！重新回到圓朱市！
第228話：水君與米那君！鳳王之傳說！
第229話：在神奇寶貝勁速賽中向前衝！
第230話：名偵探君莎，蛋不見了，大搜謎
第231話：蛋要孵化了
第232話：火箭隊跟信使鳥
第233話：霧中的九尾
第234話：巴爾郎與空手道王信彥
第235話：天然鳥的大預言
第236話：渡與紅色暴鯉龍
第237話：紅色暴鯉龍之憤怒
第238話：長毛豬與冬天的柳伯
第239話：卡吉道館，冰之戰鬥
第240話：美麗花對抗霸王花！草原的和平
第241話：熔岩蝸牛，用火熱的心來收服！
第242話：神奇寶貝魔法大變身
第243話：閃電鳥跟水晶，湖的秘密
第244話：雙胞胎的寶寶丁對抗胖丁，唱歌神奇寶貝演唱會
第245話：呆呆獸之悟，小智之悟
第246話：假大木博士,神奇寶貝川柳對決!
第247話：皮寶寶跟皮皮跟流星
第248話：蚊香蛙的進化
第249話：競技公園vs.水箭龜、噴火龍、妙蛙花
第250話：牛蛙君跟啦啦隊
第251話：冰之洞窟
第252話：小樁跟迷你龍
第253話：煙墨道館的龍之牙
第254話：快龍，逆鱗立起
第255話：煙墨道館最後的徽章
第256話：道館徽章與果然翁
第257話：龍宮道館,在水中戰鬥！
第258話：乘龍之歌！
第259話：保護蛋,在暴風雨中誕生的生命！
第260話：炎帝與溫泉的同伴們！
第261話：河馬王，王者的信物
第262話：奈奈與電擊怪
第263話：由基拉加油
第264話：不可思議之國的未知圖騰
第265話：班吉拉與由基拉
第266話：狃拉與聖火
第267話：白銀大會跟小茂再度交手!!
第268話：預賽聯盟!火岩鼠，火焰的戰鬥!!
第269話：大菊花對抗妙蛙種子！草系神奇寶貝的志氣
第270話：決勝錦標賽！全面作戰6VS6!!!
第271話：勁敵對決!!水箭龜對抗噴火龍!!
第272話：再度遭遇火焰雞!!與葉越的戰鬥!!
第273話：全力戰鬥之後!!各人的道路!!
第274話：再見和啟程
第275話：與皮卡丘分手
註：第38話：電腦戰士3D龍 因為著名的光過敏事件所以台灣沒有播出
在38話之後的話數通通往前一話