[問題] 哪裡的R才是對的路徑？

[rn940111 (卡比)]

[問題類型]:  版本安裝位置


[軟體熟悉度]:
請把以下不需要的部份刪除
使用者(已經有用R 做過不少作品)

[問題敘述]:

一般來說使用mirror下載的R.pkg 會安裝在  /Library/Framework/R.Framework/....

我安裝在這邊的版本是3.4.2

之前都是用遠端螢幕控制寫R，發現MacOS也能裝RStudio Server後就決定改用這個，

但是剛剛在安裝RStudio Server跟Hadoop的時候我是利用terminal下指令，

搞定了server之後發現RStudio吃的版本跟R GUI吃的版本不同

RStudio現在使用的是/usr/local/cellar/r/3.4.3，

也就是剛剛透過安裝server而指定的路徑

R GUI則是使用/Library/Framework/R.Framework/....

如果是在terminal開R，則是跟R GUI使用相同版本

在這之前RStudio跟R GUI使用的R版本與library路徑都相同，

但是現在兩者的路徑不同了。

（同時 3.4.2 無法判定Taipei時區，所以不能安裝某些包而使得R session出錯，

希望使用3.4.3！）

嘗試重新安裝R.pkg之後，RStudio的版本回歸正常，但是server版本仍為3.4.3




其實我不是很確定兩種路徑哪一種才是放在最正確的位置，

這樣我是應該選擇

1. 指定library的安裝與讀取路徑到原本的/Library/Framework/R.Framework/...
   並且讓RStudio固定使用/usr/local/bin/R的版本（往後必須注意更新路徑）

2. 把library的所有東西複製到/usr/local/lib/R/library下，
   並且往後固定把R安裝在這，讓RStudio以後都在這裡執行（以後別使用pkg安裝）

3. 改變RStudio的讀取路徑，並且把3.4.3的版本放到3.4.2之路徑下，
   往後不使用terminal進行安裝（不確定是否會使得RStudio Server失效）


3的實際作法正在尋找中，但感覺應該是相對不實際的作法



[環境敘述]:

MacOS x64  (High-Sierra)

R version 3.4.3 / 3.4.2


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※ 編輯: rn940111 (140.109.73.198), 12/04/2017 21:16:53
→ parcequetoi: 我以為library本來就沒有所謂"正確"的路徑，不都是自
→ parcequetoi: 己視需要設定的嗎？ @@
→ parcequetoi: Server跟Client放套件的路徑不同感覺也很正常
→ parcequetoi: 題外話，我好奇在MacOS裝Server版有什麼功用
→ rn940111: 我想要在外面用iMac跑，所以我希望server讀的東西跟我本
→ rn940111: 機的版本一樣
→ rn940111: 問題在於"正確的版本路徑"而非library      library本來
→ rn940111: 就是最好解決的
→ andrew43: 有時候一個soft link就解決了。玩壞的機率也不大。
→ andrew43: 不過我不確定library能不能直接餵食
→ andrew43: 或在不同版間互通
→ Wush978: 因為你是用homebrew 裝的rstudio server吧，所以預設會
→ Wush978: 連到homebrew的R。方便起見，我建議你全部以homebrew
→ Wush978: 的為主，把R.pkg的刪掉即可。這樣裝rJava等套件遇到問題
→ Wush978: 的機會也比較小...
→ bluecadence: 其實軟體版本也沒有什麼"正確"安裝的路徑，當然不同
→ bluecadence: 作業系統傳統上有一些傳統的安裝路徑，可是那都是可
→ bluecadence: 變更的。重點是自己指定要安裝在那，使用的時候路徑
→ bluecadence: 有沒有指定正確(binary code or lib, etc)。
→ bluecadence: 多個版本，有時候跑這版本有時跑那個版本，原因是
→ bluecadence: 有時候你指定了絕對路徑，有時候你又沒有指定絕對路
→ bluecadence: 徑，所以系統就按照可執行檔案路徑參數的優先次序抓
→ bluecadence: 優先度高的路徑版本跑。不然就是有時候有你不知道的
→ bluecadence: symbolic link 存在。
→ bluecadence: 然後你的"library"是指R的套件(packages)的library嗎
→ bluecadence: ?不同版本的R或許可以/或不可以共用library 如果R在
→ bluecadence: 編譯的時候使用的條件不同。不過MacOS或許比較沒這問
→ bluecadence: 題
→ andrew43: 我支持全都從單一介面（如brew）建立系統。不然之後更新
→ andrew43: 時都要手動確定很多設定，不是很方便。