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生物:SARS病毒從哪來? 編輯:wcchou 新加坡基因體研究所根據自行解出的5條SARS病毒的序列,並納入其他國家日前 公佈的9條序列進行分子親緣比對,以瞭解目前病毒突變的狀況,更藉此想找出病毒 的來源。 自四月中加拿大科學家率先發表SARS病毒基因序列以來(詳見Sciscape新聞— SARS病毒基因解碼),其他SARS研究團隊也陸續公佈自己國內的SARS病毒序列,台灣 則是由台灣大學於數日前公佈台灣第一條完整的SARS病毒序列。在這些研究團隊中, 以新加坡基因體研究所的研究進度最為迅速,他們不但自行解出五條不同SARS患者的 病毒序列,並且完成與其他團隊發表之病毒序列的比對分析工作。 目前NCBI網站上已經公佈有14條SARS病毒完整序列(新加坡5條、香港2條、中國5 條、美國1條、加拿大1條),新加坡的科學家針對這已知的14條序列進行比對,期望 從序列的變異程度得到一些訊息。科學家初步分析發現在這14條序列中只有127個位置 發生核甘酸變異,而其中94個造成胺基酸改變,突變數目不到整個病毒序列的0.5%。 在這127個變異位置只有16個位置的變異存在兩條以上的序列,這表示多數的核甘酸變 異屬於病毒自發性的突變,因此科學家只利用這16個變異位置來分析病毒演化的親緣關 係。科學家在比對這幾個關鍵的變異位置中認為這14條序列可以被分為兩種基因型, 其中一種包含新加坡5條、香港1條、美國1條、加拿大1條共8條序列,這8個患者SARS 目前已經知道與香港九龍京華酒店的傳染有關,都是被一名來自廣東的旅客所感染; 至於另外6條的來源則集中於中國的北京與廣東。科學家根據分子標記與流行病學的研 究結果均共同指向廣東就是這次SARS傳染的發源地。 至於我們擔心病毒是否快速變異這件事,科學家根據分析結果認為病毒應該已經 適應與人類共存的環境,因此短時間內病毒應該不會有病毒變種產生,不過對於已知 的127個變異對於病毒的功能是否有影響,科學家認為還需要再深入探討。對於「病毒 未快速變異」這件事,科學家覺得有如雙刃劍有好有壞,在壞的一方面是我們不能期 望病毒會因為突變導致毒性減弱而降低死亡率,但是好的一面是科學家發展的疫苗將 不用擔心病毒快速突變而失去效用。 從SARS病毒發現至今不過一個多月,相關的研究工作已如火如荼的展開中,雖然 所有的基因序列已被解出,但是想瞭解每個基因所表現蛋白的功能,看來還有很長的 路要走。 原始論文 Ruan YJ et al. Comparative full-length genome sequence analysis of 14 SARS coronavirus isolates and common mutations associated with putative origins of infection. The Lancet, Published online May 9, http://image.thelancet.com/extras/03art4454web.pdf (2003) -- 刺胳針刺胳針... -- 從現在起 流浪是我的名字 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.csie.ntu.edu.tw) ◆ From: 210.85.210.74