故事發生在漫畫第一部與第二部之間。

講述了已成為CCG上等搜查官的鈴屋什造和新人二等搜查官阿原半兵衛，

於13區調查喰種集團「骷髏面具」的故事。



鈴屋什造和阿原半兵衛等人駐守的13區，

受到了一群戴著骷髏面具的喰種組織的襲擊，

為了應對這些喰種，鈴屋等人必須全力以赴，找到兇手——骷髏面具組織的首領。


一天，他們乘坐電車的時候，在電車裡看到了一位少女……