弗朗索瓦·庫普蘭1668年生於巴黎，父親是在巴黎聖-熱爾韋（Saint-Gervais）
教堂擔任管風琴師的夏爾·庫普蘭。他跟隨父親學習管風琴直到12歲時父親去世。
德拉朗德（
Michel-Richard Delalande）繼承了他父親的位置。
弗朗索瓦·庫普蘭跟隨雅克·托梅蘭學藝並開始代理德拉朗德演奏，
18歲時教區行政團指定弗朗索瓦·庫普蘭繼承父業，擔任教堂管風琴師。
1693年托梅蘭去世，弗朗索瓦·庫普蘭接替他成為凡爾賽宮皇家教堂管風琴師，
稱「國王的管風琴師」（organiste du Roi）。
次年成為王室成員的羽管鍵琴教師。
1702年受封為「羅馬騎士」並獲得「拉特朗騎士勳章」，
稱「德·庫普蘭騎士」。
1717年獲得「國王室內樂團」羽管鍵琴師的職位
（ordinaire de la musique de la chambre du Roi）。

弗朗索瓦·庫普蘭早婚，長女瑪麗·瑪德琳（Marie-Madeleine，1690年-1742年）
加入了宗教團體，同時也是位業餘的管風琴演奏者；
次女瑪格麗特-安托瓦內特（Marguerite-Antoinette，1705年-1778年）成為音樂家，
1730年繼承父位成為「國王室內樂團」羽管鍵琴師；
兒子弗朗索瓦-洛朗（François-Laurent）早夭。
1733年，弗朗索瓦·庫普蘭將巴黎聖-熱爾韋教堂管風琴師的職位傳給侄子尼古拉。
同年9月12日，弗朗索瓦·庫普蘭在巴黎去世，葬於聖-歐斯塔什教區的聖約瑟教堂。