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如題 大家好 朋友在做rnaseq後 在分析完基因表現量再去找有顯差基因的時候 給別人試跑後 跑出來的data的表現量有0 0應該是沒有reads吧 但是fold change卻可以算出來 想很久看不出來0還會有fold change 想請教大大 並附上excel圖 https://i.imgur.com/DmMsbAh.jpg -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 39.8.2.9 (臺灣) ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/BioMedInfo/M.1648745826.A.18D.html
allqwdd: 這看起來是DESeq2的結果,DESeq2用的是Read counts做 04/05 18:39
allqwdd: 計算,不是用FPKM。先跟朋友確認一下他的Input是什麼 04/05 18:39