作者dontsteal896 (violence阿公)
看板BioMedInfo
標題[問題]rnaseq分析 基因表現量算法
時間Fri Apr 1 00:57:04 2022
如題
大家好
朋友在做rnaseq後
在分析完基因表現量再去找有顯差基因的時候
給別人試跑後
跑出來的data的表現量有0
0應該是沒有reads吧
但是fold change卻可以算出來
想很久看不出來0還會有fold change
想請教大大
並附上excel圖
https://i.imgur.com/DmMsbAh.jpg
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推 allqwdd: 這看起來是DESeq2的結果,DESeq2用的是Read counts做 04/05 18:39
→ allqwdd: 計算,不是用FPKM。先跟朋友確認一下他的Input是什麼 04/05 18:39