作者shiningspark (阿冠)
看板Biotech
標題[方法] Bacterial artificial chromosome (BAC)
時間Mon Feb 2 20:56:40 2015
請教各位,
最近可能需要用 BAC 來 clone 100 kb 左右的 genome,
現在手邊只有 DH5alpha 跟 TOP10F' 這兩支菌,
各位用過這兩支菌做 electroporation 嗎?
100 kb 左右的 plasmid 電進去的效率高嗎?
查到 DH5alpha 做 electroporation 好像 plasmid size 上限也只能到 10 kb 左右,
一般建議是用另外一隻 DH10B,比較會吃大 size 的 plasmid。
但手邊的 TOP10 好像跟 DH10B 基因型很相像,
如果 TOP10 就可以用的話,也能省下一筆錢跟時間。
另外,對這兩支菌來說,電壓一般都使用 1800 V 左右嗎?
希望有經驗的前輩們給點意見囉,
謝謝! orz
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 220.135.246.236
※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1422881803.A.52C.html
※ 編輯: shiningspark (220.135.246.236), 02/02/2015 21:54:53
推 ljii: 標準是作DH10B沒錯, TOP10也可以, 我都用過, 都沒問題 02/03 10:28
→ ljii: 我的BAC 150-200kb都有 02/03 10:28
→ ljii: 不過我還不曉得DH5a 吃不下10kb, 因為我試過是可以的, 我的 02/03 10:29
→ ljii: construct 30kb, 存在DH5a, 之後再prep也沒問題 02/03 10:29
→ ljii: 我想只是效率問題吧, 而效率問題根本沒差, 成功有一個clone 02/03 10:30
→ ljii: 吃進去, 就可以作stock, 無限放大了 02/03 10:30
→ shiningspark: 謝謝囉, 可能看到 heat shock 的資料才是 10kb 吧 02/03 12:12
→ shiningspark: 沒錯, 總之想辦法把效率提高就是了 02/03 12:18